摘要
以感染菌核病桑果和健康桑果为材料,采用Illumina MiSeq高通量测序,分析二者内生菌群落结构组成及多样性变化,充分挖掘桑果内生菌资源,探讨伴生菌与菌核病病原菌互作关系,为建立桑果微生物信息系统、桑果菌核病的病原学研究以及生物防治提供参考.结果表明:根据97％的序列相似性水平,可以将细菌和真菌分别归类为281个和259个非重复可操作分类单元(operational taxonomic units,OTU).内生细菌群落以蓝藻门(Cyanobacteria)、变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、拟杆菌门(Bacteroidetes)为主,Cyanobacteria_norank、Mitochondria_norank 2个细菌属在病果中呈明显下降趋势,敏感性较强.内生真菌群落以子囊菌门(Ascomycota)、Fungi_unclassified、担子菌门(Basidiomycota)为主,Fungi_unclassified、Basidiomycota受病原菌影响较大,其中Fungi_unclassified几乎不存在于感病组,Basidiomycota下降99.07％.内生真菌多样性可明显划分感病果实和健康果实的界限,且感病果实内生真菌多样性远小于健康果实.LEfSe显著差异分析表明,泛菌属(Pantoea)是病果中重要的细菌类群,Ascomycota及其分支锤舌菌纲(Leotiomycetes)、柔膜菌目(Helotiales)、核盘菌科(Sclerotiniaceae)和杯盘菌属(Ciboria),粪壳菌纲(Sordariomycetes),座囊菌纲(Dothideomycetes),炭角菌目(Xylariales)及其分支(Xylariales_f_Xylariales_fam_Incertae_sedis,Monographella)是健康果实与感病果实间重要显著差异的生物标识.
基金项目
重庆市科研机构绩效激励引导专项(cstc2018jxjl0118)
重庆市农业科学院青年创新团队项目(NKY-2019QC08)
重庆市农发资金-良种创新重大项目(NKY-2016AA002)
重庆市特色水果产业技术体系项目(2020303)
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