不同植物DNA条形码对铁皮石斛鉴定能力的评价

Evaluation of the Ability of Different Plant DNA Barcodes to Identify Dendrobium officinale

陈文强 ¹汪小福 ²陈笑芸 ²彭城 ²徐俊锋 ²蔡健³

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作者信息

1. 浙江省农业科学院,农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室,浙江杭州 310021;阜阳师范大学生物与食品工程学院,安徽阜阳 236037
2. 浙江省农业科学院,农产品质量安全危害因子与风险防控国家重点实验室,浙江杭州 310021
3. 阜阳师范大学生物与食品工程学院,安徽阜阳 236037
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摘要

为选择适合准确鉴定铁皮石斛的DNA条形码,以25份铁皮石斛样品和10份其他不同种类石斛为实验材料,利用目前常用的9条植物DNA条形码(ITS2、nad1、matK、ycbL、psbK-psbI、trnL-trnF、trnG-trnS、rbcL和trnH-psbA)对这些石斛材料进行分子鉴定.结果显示,9条DNA条形码的扩增率和测序成功率均很高,通用性很强.其中,rbcL与trnH-psbA的种内最大遗传距离大于种间最小遗传距离,不符合条形码的基本要求,其余条形码遗传距离均符合种内最大遗传距离小于种间最小遗传距离的要求.种间变异顺序为ITS2＞ trnL-trnF＞ trnG-trnS＞psbK-psbI＞ ycf1b＞matK＞ nad1,其中ITS2的进化速率最快,变异率最高(25.1％).ITS2和trnL-trnF对本实验中石斛材料的分辨率达到90.1％,建议ITS2+ trnL-trnF作为铁皮石斛种质资源鉴定的DNA条形码.本研究为利用DNA条形码技术鉴别铁皮石斛及其近源种石斛提供了参考和分子依据.

关键词

铁皮石斛/DNA条形码/分子鉴定/遗传距离

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基金项目

国家自然科学基金面上项目(31772098)

安徽省高校自然科学研究重点项目(KJ2018A0352)

出版年

2021

食品科学

北京食品科学研究院

食品科学

CSTPCDCSCD北大核心

影响因子：1.327

ISSN：1002-6630

被引量6

参考文献量15

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