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1株产VB12球形赖氨酸芽孢杆菌C5.1的分离、全基因组测序及分析

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  • 万方数据
为深入探究球形赖氨酸芽孢杆菌C5.1(Lysinibacillus sphaericus C5.1)菌株产VB12的作用机制,利用PacBio Sequel和Illumina NovaSeq PE150相结合的方法对C5.1菌株进行全基因组测序,并对测序数据进行拼接、基因预测及功能注释.结果表明,C5.1菌株基因组为一个环状DNA,不含质粒,大小为4 690 817 bp,GC含量为37.21％,预测得到4 756个编码基因,111个tRNA基因和34个rRNA基因.通过基因本体论、直系同源集、京都基因与基因组百科全书和转运蛋白分类数据库对C5.1菌株基因组进行注释分析,分别匹配到3 095、3 182、4 374个和397个基因.进一步分析发现C5.1菌株基因组中包含从尿卟啉原Ⅲ逐步转化合成VB12的关键酶.本研究为解析C5.1菌株在臭腐乳发酵过程中的代谢机理提供遗传信息基础,也为今后开展发酵食品中VB12的生物合成机制研究提供理论支撑.
Isolation and Whole Genome Sequencing Analysis of VB12-Producing Lysinibacillus sphaericus Strain C5.1

赵磊、徐琼、刘洋、张奕南、钟江

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上海市质量监督检验技术研究院,国家市场监管重点实验室(乳及乳制品检测与监控技术),上海 200233

复旦大学生命科学学院,上海 200433

发酵食品 赖氨酸芽孢杆菌 VB12 全基因组测序 基因功能注释

国家市场监督管理总局科技计划上海市质量监督检验技术研究院科技计划

2017QK167KY-2021-1SP

2023

10.7506/spkx1002-6630-20220418-233

食品科学
北京食品科学研究院

食品科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.327
ISSN：1002-6630
年,卷(期)：2023.44(6)
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