基于分子对接和表面等离子共振技术分析虾青素与跨膜转运蛋白CD36的结合作用

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中文摘要：目的:探究虾青素与跨膜转运蛋白白细胞分化抗原36(cluster determinant 36,CD36)的结合作用.方法:采用分子对接技术模拟虾青素与CD36的结合作用,结合算法获得相互作用参数,确定结合位点,建立最佳匹配模型.同时,利用表面等离子共振技术测定分子间相互作用的结合和解离常数.结果:虾青素进入CD36内部的疏水腔中,对接结合能为-11.70kcal/mol,且呈剂量依赖性结合,解离平衡常数KD为1.00× 10-6mol/L,表明虾青素与CD36以高亲和力结合,且动力学曲线显示虾青素与CD36的结合模式为慢结合慢解离;虾青素与CD36更多的氨基酸结合形成疏水相互作用,不同于叶黄素和β-胡萝卜素与CD36的极性氨基酸Asn53形成弱的范德华力,虾青素与天冬酰胺Asn53形成氢键作用,可能是虾青素以高亲和力结合CD36的部分原因,同时推断虾青素末端环上的酮基或羟基与酮基形成的α-羟基酮对于形成氢键起一定作用.结论:虾青素与CD36发生自发的相互作用且以高亲和力结合,结合模式为慢结合慢解离,从而实现有效的跨膜转运.

外文标题：Analysis of Astaxanthin Binding to Transmembrane Transporter Protein Cluster Determinant 36 Using Molecular Docking and Surface Plasmon Resonance

外文关键词：

astaxanthincluster determinant 36molecular dockingsurface plasmon resonance

作者：

张俊林、陈祉晴、郑钦生、肖杰、曹庸、刘晓娟

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作者单位：

华南农业大学食品学院,广东省功能食品活性物重点实验室,广东广州 510642

关键词：

虾青素白细胞分化抗原36 分子对接表面等离子共振技术

基金：

国家自然科学基金面上项目广东省自然科学基金广东省自然科学基金广州市重点研发计划

项目编号：

321721952019A15150113912021A1515012158SL2022B03J00806

出版年：

2023

DOI：

10.7506/spkx1002-6630-20220929-329

食品科学

北京食品科学研究院

食品科学

CSTPCDCSCD北大核心

影响因子：1.327

ISSN：1002-6630

年,卷(期)：2023.44(12)

参考文献量4