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基于比较基因组学解析植物乳植杆菌ST的功能基因组

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解析植物乳植杆菌(Lactiplantibacillus plantarum)ST的功能基因组特征,为其开发利用奠定基础.对L.plantarum ST与1株模式菌株ATCC 14197T基因组序列及NCBI中已公开的152株L.plantarum全基因组序列进行比较基因组学分析.基于154株L.plantarum的1 262个核心基因构建了系统发育树,发现ST与肠道分离株BCC9546遗传距离最近.乳、肉制品分离株分别集中在第II分支的上半部分和下半部分,因来源不同而存在差异,且存在一定的聚集性.同时果蝇分离株具有明显聚集趋势.功能注释分析发现,ST基因组中包含磷酸转移酶系统糖类转运系统相关基因,还注释到了免疫调控通路相关基因,同时有较多水解或重排糖苷键的基因.ST不存在毒力因子和耐药基因.与其他L.plantarum相比,ST携带特有的与能量转运功能有关的功能基因ecfT.此外,ST具有与群体感应信号分子AI-2、黏附分子和谷胱甘肽合成相关的功能基因.API 50 CHL碳水化合物代谢结果显示,L.plantarum ST能利用丰富的碳源,可代谢包括单糖类、糖苷和二糖类及多糖类等中29种碳源.本研究从基因组层面分析L.plantarum ST功能基因组特征,同时结合糖发酵表型实验结果,认为L.plantarum ST是1株安全且具有潜在益生特性的益生菌,为其开发利用提供遗传学基础.
Comparative Genomic Analysis of Functional Genomics of Lactiplantibacillus plantarum ST

Lactiplantibacillus plantarum STcomparative genomicsfunctional genes

杨淑娟、周金萍、李海燕、曹振辉、孙志宏、林秋叶

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内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室,农业农村部奶制品加工重点实验室,内蒙古自治区乳品生物技术与工程重点实验室,乳酸菌与发酵乳制品省部共建协同创新中心,内蒙古呼和浩特 010018

云南农业大学食品科学技术学院,云南 昆明 650201

云南农业大学动物科学技术学院,云南昆明 650201

植物乳植杆菌ST 比较基因组学 功能基因

国家自然科学基金地区科学基金云南省孙志宏专家工作站项目兴滇英才支持计划青年人才项目

31760448202105AF150055YNWR-QNBJ-2018-137

2023

10.7506/spkx1002-6630-20220807-086

食品科学
北京食品科学研究院

食品科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.327
ISSN：1002-6630
年,卷(期)：2023.44(14)
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