1株牦牛乳源产细菌素融合魏斯氏菌ZW21全基因组测序及序列分析

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中文摘要：融合魏斯氏菌(Weissella confusa)ZW2 1是1 株具有良好抗菌活性的牦牛乳源乳酸菌,为探索其抗菌机理,分析其全基因组序列并挖掘该菌株的抗菌等功能特性基因.本研究基于Illumina NovaSeq PE150平台对W.confusa ZW21进行全基因组测序分析,并采用基因功能、京都基因与基因组百科全书、蛋白质直系同源簇、非冗余蛋白、碳水化合物活性酶数据库、转运蛋白分类数据库进行基因组基本功能注释.结果表明:W.confusa ZW21的基因组大小为2.44 Mb,GC含量45.66％;预测到2 175 个编码基因,编码基因总长度为1 947 771 bp,平均长度为896 bp;通过功能数据库对该菌株基因组基本功能注释和代谢通路基因信息注释可知,基因组中含有8 种细菌素(如大肠菌素V和乳球菌素)相关基因、3 种与抗氧化活性相关基因,以及可调控免疫和炎症信号通路(如核苷酸结合寡聚化结构域样受体蛋白受体信号通路、过氧化物酶体增殖物激活受体信号通路)和编码抗叶酸的基因.综上,W.confusa ZW21全基因组测序及分析为研究其抗菌机理提供基础.

外文标题：Whole Genome Sequencing and Sequence Analysis of a Yak Milk-Derived Bacteriocin-Producing Weissella confusa ZW21

外文关键词：

yak milkWeissella confusawhole genome sequencinggene function annotationbacteriocin

作者：

郑雪、梁琪、宋雪梅、张炎

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作者单位：

甘肃农业大学食品科学与工程学院,甘肃兰州 730070

甘肃省功能乳品工程实验室,甘肃兰州 730070

关键词：

牦牛乳融合魏斯氏菌全基因组测序基因功能注释细菌素

基金：

国家自然科学基金地区科学基金

项目编号：

31660468

出版年：

2023

DOI：

10.7506/spkx1002-6630-20221126-303

食品科学

北京食品科学研究院

食品科学

CSTPCDCSCD北大核心

影响因子：1.327

ISSN：1002-6630

年,卷(期)：2023.44(20)

参考文献量6