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柑橘酸腐病菌PacC的生物信息学分析及其响应pH值的表达模式

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酸腐病菌(Geotrichum citri-aurantii)可调节侵染位点的pH值增强其致病性,pH值信号转导途径关键转录因子PacC在真菌响应环境pH值变化中发挥重要功能,但PacC在酸腐病菌中的作用尚不清楚.从酸腐病菌基因组中注释到2 个PacC候选基因,对其进行生物信息学分析,并研究不同pH值条件下的表达模式.结果表明,PacC1与PacC2属于C2H2蛋白家族成员,且与指状青霉(Penicillium digitatum)PacC的亲缘关系较近.PacC1与PacC2在染色体位置、蛋白质分子质量和等电点等方面存在差异.离体条件下,酸腐病菌具有广泛的pH值适应性,最适pH值为3.0.PacC1和PacC2的表达均受pH值调控,且两个基因的表达趋势具有一定相似性.活体条件下,pH>3.0的宫川蜜橘果实组织中,酸腐病发病部位pH值随着发病进程显著下降,而pH<3.0的尤力克柠檬果实组织中,发病部位pH值显著上升,同时PacC1与PacC2的相对表达量均呈上升趋势.综上可知,环境pH值对酸腐病菌的生长有一定影响,酸腐病菌也对环境pH值有一定调节能力.由于基因结构和理化性质的差异,酸腐病菌的2 个PacC对pH值的响应程度和方式有一定差别,它们对于酸腐病菌广泛的pH值适应性及促进柑橘果实侵染进程具有重要作用.
Bioinformatics Analysis of PacC Gene of Geotrichum citri-aurantii Isolated from Citrus Fruit and Its Expression Pattern in Response to pH

Geotrichum citri-aurantiiPacCbioinformaticspHexpression pattern

郑杰、谭小丽、胡近近、陶能国、欧阳秋丽、李茂慧、李路

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湘潭大学化工学院,湖南 湘潭 411105

酸腐病菌 PacC 生物信息学 pH值 表达模式

国家自然科学基金青年科学基金湖南省自然科学基金湖南省大学生创新创业训练计划

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2023

食品科学
北京食品科学研究院

食品科学

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:1.327
ISSN:1002-6630
年,卷(期):2023.44(22)
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