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浙贝母鲨烯合酶核心功能区基因克隆与序列分析

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目的:克隆浙贝母次级代谢途径的关键酶——鲨烯合酶(SQS)的基因,有助于对次生代谢产物的合成进行调控.方法:根据NCBI上公布的8种植物SQS蛋白序列,分析高度保守区并设计简并引物.从浙贝母幼根中提取总RNA,利用RT-PCR技术成功扩增出高度保守区基因片段.再利用GSP引物和RACE技术中克隆出3’末端片段.结果:获得浙贝母SQS 1 122bp核苷酸序列,编码374个氨基酸.Protein-Blast比对发现与印度甘松、柴胡、马铃薯、拟南芥、紫杉五种植物的同源性分别达到76％、74％、75％、74％、73％,包含了底物结合位点、Mg2+结合位点、催化活性位点等.该序列在Genbank中的登录号为:KF551097.结论:通过蛋白质特征区、保守区以及进化树分析,初步确定该基因为SQS基因.这是首次从药用植物浙贝母中克隆得到甲羟戊酸途径关键酶SQS的基因核心功能片段,为浙贝母次生代谢工程研究打下良好的基础.
Cloning and Sequence Analysis of Core Functional Domain Fragment of Squalene Synthase of Fritillaria thunbergii Miq

朱振洪、沈静炎、周利萍、沈信

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浙江中医药大学生物工程学院,浙江杭州310053

浙贝母 鲨烯合酶 核心功能区 RACE 序列分析

2014

10.3969/j.issn.1004-311X.2014.03.0051

生物技术
黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会 黑龙江省科学院微生物研究所

生物技术

CSCD北大核心
影响因子：0.611
ISSN：1004-311X
年,卷(期)：2014.24(3)
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