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印度节旋藻TJSD rpoC1基因部分序列的克隆与分析

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[目的]为进一步明确TJSD藻株的分类学地位,寻找用于螺旋藻、节旋藻分类的新靶标分子。[方法]采用PCR技术对印度节旋藻TJSD藻株的rpoC1基因进行扩增,利用相关生物信息学数据库及软件对其序列进行了分析。[结果]获得的rpoC1基因编码区片段长度为966 bp,GC含量为47。41%,由此推导的氨基酸的理论相对分子质量为29。16 kD,其中酸性、碱性、疏水性氨基酸的比例分别为14。29%、16。77%、42。86%,与其它蓝藻同源序列的相似度在76% ~ 99%之间。该藻株与Arthrospirasp。PCC8005藻株的遗传距离仅为0。001,在NJ树中聚在一起,且得到了100%的支持率,与蓝藻中其它属明显分为了不同的类群。[结论] TJSD为节旋藻属且rpoC1基因序列可在属及其以上水平用于节旋藻系统发育分析。
Cloning and sequence analyzing of rpoC1 gene encoding from Arthrospira indica TJSD

吴跃梅、董世瑞、王博彦、魏娟、王素英

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天津商业大学生物技术与食品科学学院,天津市食品生物技术重点实验室,天津300134

印度节旋藻 rpoC1基因 克隆 序列分析 系统发育分析

国家自然科学基金国家级大学生创新创业训练计划

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2015

生物技术
黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会 黑龙江省科学院微生物研究所

生物技术

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.611
ISSN:1004-311X
年,卷(期):2015.25(3)
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