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不同海拔血满草居群cpDNA psbA-trnH序列特征及其遗传结构

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[目的]针对云南常用民族药血满草遗传背景研究少的现状,利用叶绿体DNA分析血满草遗传多样性和遗传背景.[方法]采集5个不同海拔分布的野生血满草居群,通过PCR技术扩增psbA-trnH序列并测序,然后利用生物学软件分析序列特征以及不同野生居群遗传多样性.[结果]血满草psbA-trnH序列长度范围在487～530 bp之间,GC含量为29.12～30.17％.Bioedit软件排列比对后长度为485 bp,其中有45个信息位点,包括1个单碱基缺失、15个点突变、29个同源信息位点.根据该序列,DnaSP软件分析表明血满草多样性(pi)为0.02004,平均变异数目为9.019,构成27个单倍型,单倍型多样性为0.997.其中居群1(海拔3 343 m)多样性最高,其次是居群3(海拔3 554m),再次是居群5(海拔3 790 m),最小的为居群2(海拔3445 m).居群间的遗传分化系数在0.～0.089之间,居群间的遗传距离在0.013～0.022之间.[结论]不同海拔血满草居群之间遗传分化不明显,远低于异交生物平均水平.另外,谱系分析也表明血满草不同居群之间的系统关系不清晰,与地理分布和海拔分布的关系不明显.该结果可能与血满草为克隆繁殖、高适应能力、种子传播范围广等生活史策略相关.同时也可能是psbA-trnH序列在居群水平上分辨率不够造成.
cpDNA psbA-trnH sequence characteristics and genetic structure of Sambucus adnata Wall.at different altitudes populations

杨青松、熊勇、胡琳、赵艳、卢志敏、刘瑞

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云南民族大学民族药资源化学国家民委-教育部重点实验室,云南昆明650500

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国家自然科学基金云南省教育厅科学研究基金一般项目云南民族大学民族药资源化学国家民委-教育部共建重点实验室开放基金云南民族大学大学生创新创业训练计划项目资助

314703162014C070YMZY1301

2015

10.16519/j.cnki.1004-311x.2015.04.0069

生物技术
黑龙江省微生物学会 黑龙江省生物工程学会 黑龙江省科学院微生物研究所

生物技术

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.611
ISSN：1004-311X
年,卷(期)：2015.25(4)
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