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联合CGGA-TCGA数据库挖掘胶质瘤显著生存相关基因

Identification of genes associated with cancer prognosis in glioma based on Chinese glioma genome atlas and the cancer genome atlas databases

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利用CGGA与TCGA数据库,挖掘胶质瘤预后标志相关基因,结合差异分析、生存分析、共表达分析、临床相关性分析和ROC曲线评估预测能力,并通过TCGA验证,得到PLAT、IGFBP2、BCAT1和SERPINH1等4个可以作为独立预后标志因子的基因.分析表明,这4个基因不仅是独立的预后因子,还在不同人群中都具有较好的预后预测能力,说明找到的预后基因具有潜在的应用价值.对SERPINH1剪接事件进行分析,揭示可变剪接事件是影响患者预后的重要因素,这为进一步理解胶质瘤预后基因的特征提供了依据.

吕俊杰、张一骅、邓贵、刘佳欣、吕正禹、任付宾、陈丽娜

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哈尔滨医科大学 生物信息科学与技术学院,哈尔滨150081

哈尔滨医科大学附属第四医院,哈尔滨150081

胶质瘤 生存分析 预后因子 选择性剪接

黑龙江省卫生厅基金

2018478

2021

10.3969/j.issn.2095-1736.2021.01.018

生物学杂志
合肥市科学技术协会

生物学杂志

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.554
ISSN：2095-1736
年,卷(期)：2021.38(1)
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