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基于药物重定位策略预测治疗多发性骨髓瘤的候选化合物

Prediction of candidate compounds for treatment of multiple myeloma ( MM) based on drug reposition strategy

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采用药物重定位(Drug repositioning,DR)策略预测多发性骨髓瘤的候选化合物,为多发性骨髓瘤的治疗提供新的思路和方向.利用GEO数据库检索并筛选多发性骨髓瘤表达谱芯片数据,GEO2R软件提取差异表达基因(DEGs);DAVID和Panther数据库对差异表达基因进行富集和通路分析;利用STRING数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络分析;将差异表达基因导入CMAP连接图,计算获得治疗MM的候选化合物,进一步对候选化合物进行查找和分析.结果显示:共获得差异表达基因53个,包括上调差异表达基因10个、下调差异表达基因43个;GO分析结果表明生物学过程涉及22个功能簇,分子功能涉及5个功能簇,细胞成分涉及5个功能簇;KEGG分析涉及10条通路;蛋白-蛋白相互作用网络分析显示VCAM1、CCR2、CCL3和CXCL12等4个基因为富集程度最高的核心差异表达基因;通过CMAP连接图计算得到排名前20的候选化合物,其中LY-294002和Tanespimycin可能对MM有潜在治疗作用,但还有待深入试验研究和临床验证.

邹敏、李锐峰、陈岷、颜晓燕、史惠卿

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成都医学院 药学院,成都610500

四川省医学科学院 四川省人民医院 药学部,成都610072

中国人民解放军西部战区总医院,成都610083

药物重定位 多发性骨髓瘤 差异表达基因 候选化合物 生物信息学

成都医学院校基金科研项目

20180376

2021

10.3969/j.issn.2095-1736.2021.023

生物学杂志
合肥市科学技术协会

生物学杂志

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.554
ISSN：2095-1736
年,卷(期)：2021.38(1)
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