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谷子ZF?HD基因家族的鉴定及生物信息学分析

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[目的]ZF⁃HD是植物特有的一类调节植物生长发育和抗逆性的转录因子.对谷子ZF⁃HD进行全基因组水平的鉴定和表达分析,旨在为深入探索ZF⁃HD在谷子中的功能奠定一定的基础.[方法]利用生物信息学鉴定谷子ZF⁃HD基因家族成员,并对谷子ZF⁃HD家族成员染色体定位、理化性质、基因结构、蛋白保守结构域、进化关系和表达模式进行分析.[结果]共鉴定到谷子ZF⁃HD家族基因16个,分布在8条染色体上;进化分析发现谷子ZF⁃HD家族基因可以分为5个亚类;motif预测共鉴定到4个保守motif基序;顺式作用元件分析发现与干旱响应相关的ZF⁃HD基因共9个;谷子ZF⁃HD家族基因与拟南芥中2个基因、水稻中13个基因存在共线性;5个ZF⁃HD家族基因被预测定位到细胞核内;谷子ZF⁃HD家族基因在穗中表达最多,干旱胁迫下不同抗旱性品种中ZF⁃HD基因的表达模式不同,存在时空特异性.[结论]研究结果为深入挖掘该家族基因在谷子生长发育及逆境胁迫中发挥的作用提供理论基础.
Identification and bioinformatics analysis of ZF-HD gene family in Setaria italica

李珊、刘永琪、朱垠豪、葛星辰、段明、韩渊怀、马芳芳

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山西农业大学 农学院,山西 太谷 030801

山西农业大学 实验教学中心,山西 太谷 030801

杂粮种质创新与分子育种山西省重点实验室,山西 太谷 030801

谷子 ZF⁃HD 生物信息学分析 表达分析

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2021

10.13842/j.cnki.issn1671-8151.202105050

山西农业大学学报(自然科学版)
山西农业大学

山西农业大学学报(自然科学版)

CSTPCD北大核心
影响因子：0.461
ISSN：1671-8151
年,卷(期)：2021.41(5)
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