平菇基因组InDel标记开发及杂交菌株遗传多样性分析

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中文摘要：以1株平菇白色变异菌株以及黑色出发菌株为试验材料,采用全基因组重测序技术对两个菌株进行重测序,针对InDel变异位点设计17对引物对两个菌株的孢子单核菌株及杂交菌株进行遗传多样性分析.结果表明:重测序获得平菇白色变异菌株1 763 Mb高质量数据,平菇黑色出发菌株1 779 Mb高质量数据,在平菇白色变异菌株检测到331 099个InDel变异位点,在平菇黑色出发菌株中检测到339 682个InDel变异位点.随机选择InDel变异位点并设计引物进行PCR扩增试验,最终选择17对引物对变异菌株的单核菌株以及杂交菌株进行PCR扩增,研究其遗传多样性;结果17对引物中P4、P7、P8、P9、P14菌株具有明显的多态性.进一步对12个平菇杂交菌株进行扩增,共扩增出30条清晰条带,其中扩增条带最多的引物是P9菌株,共扩增出9条条带,扩增引物最少是P14菌株,扩增出3条条带,多态性位点占66％.用5对引物对12份材料进行遗传多样性分析,发现平菇P9菌株扩增条带中多数材料均能在760 bp处扩增出多态性条带.

作者：

夏会楠、李东晓、冯璠、孙悦、王春霞、郑素月

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作者单位：

河北工程大学园林与生态工程学院,河北邯郸 056038

关键词：

重测序 InDel标记交配型鉴定变异菌株遗传多样性分析

基金：

河北省现代农业产业技术体系建设项目食用菌创新团队建设专项河北省农业科技成果转化项目

项目编号：

HBCT2023090207202360101010014

出版年：

2024

食用菌

上海市农业科学院

食用菌

影响因子：0.417

ISSN：1000-8357

年,卷(期)：2024.46(3)

参考文献量9