食用菌2024,Vol.46Issue(3) :37-41.

平菇基因组InDel标记开发及杂交菌株遗传多样性分析

夏会楠 李东晓 冯璠 孙悦 王春霞 郑素月
食用菌2024,Vol.46Issue(3) :37-41.

平菇基因组InDel标记开发及杂交菌株遗传多样性分析

夏会楠 1李东晓 1冯璠 1孙悦 1王春霞 1郑素月1
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  • 1. 河北工程大学园林与生态工程学院,河北邯郸 056038
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摘要

以1株平菇白色变异菌株以及黑色出发菌株为试验材料,采用全基因组重测序技术对两个菌株进行重测序,针对InDel变异位点设计17对引物对两个菌株的孢子单核菌株及杂交菌株进行遗传多样性分析.结果表明:重测序获得平菇白色变异菌株1 763 Mb高质量数据,平菇黑色出发菌株1 779 Mb高质量数据,在平菇白色变异菌株检测到331 099个InDel变异位点,在平菇黑色出发菌株中检测到339 682个InDel变异位点.随机选择InDel变异位点并设计引物进行PCR扩增试验,最终选择17对引物对变异菌株的单核菌株以及杂交菌株进行PCR扩增,研究其遗传多样性;结果17对引物中P4、P7、P8、P9、P14菌株具有明显的多态性.进一步对12个平菇杂交菌株进行扩增,共扩增出30条清晰条带,其中扩增条带最多的引物是P9菌株,共扩增出9条条带,扩增引物最少是P14菌株,扩增出3条条带,多态性位点占66%.用5对引物对12份材料进行遗传多样性分析,发现平菇P9菌株扩增条带中多数材料均能在760 bp处扩增出多态性条带.

关键词

重测序/InDel标记/交配型鉴定/变异菌株/遗传多样性分析

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基金项目

河北省现代农业产业技术体系建设项目食用菌创新团队建设专项(HBCT2023090207)

河北省农业科技成果转化项目(202360101010014)

出版年

2024
食用菌
上海市农业科学院

食用菌

影响因子:0.417
ISSN:1000-8357
参考文献量9
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