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番茄Dicer-like蛋白基因家族生物信息学与表达分析

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Dicer-like蛋白(DCLs)是RNA沉默机制中的重要参与者，通过miRNA进行基因调控和植物的抗病毒保护，并且还与其他生物和非生物胁迫有关。研究番茄中DCLs的蛋白质基本功能以及SlDCLs对环境的响应，可以为DCLs参与抗逆途径及其在逆境中的作用提供理论依据。为深入了解番茄中RNaseⅢ核酸内切酶Dicer-like蛋白基因家族的特征，利用生物信息学的方法对番茄DCL蛋白基因家族成员进行染色体定位，分析蛋白质基本理化性质、系统发育进化、启动子顺式作用元件、蛋白质结构域等。并通过qRT-PCR方法检测基因在组织中的表达模式和对激素、低温、盐、干旱等胁迫的响应。结果表明:番茄DCL基因有7个，分为4个家族;主要蛋白结构域有5个，启动子区域有响应各类激素、光信号、干旱等逆境的顺式作用元件，包括SlDCL1启动子区域的响应低温作用元件，SlDCL2a的SA、ABA响应元件，SlDCL2b的光响应元件，SlDCL2c的ABA，Me-JA响应元件，SlDCL2d的赤霉素响应元件，SlDCL3的Me-JA、SA响应元件，SlDCL4的干旱响应元件。结果表明:DCL家族基因在不同组织中具有不同的表达模式;激素、低温和渗透胁迫处理可以抑制或激活该家族成员的表达。SlDCL1直接响应低夜温，SlDCL2a对渗透胁迫响应明显;SlD-CL2b的转录水平受到NACl的负调控;SlDCL2c受到低温以及ABA的正调控;SlDCL2d受NACl与PEG的负调控;PEG可以促进SlDCL3和SlDCL4的表达。
Bioinformatic and Expression Analysis of Tomato Dicer-like Protein Gene Family

高振华、李漾漾、王峰、齐明芳、李天来、刘玉凤

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沈阳农业大学园艺学院/设施园艺省部共建教育部重点实验室/北方园艺设施设计与应用技术国家地方联合工程研究中心(辽宁),沈阳110161

番茄 DCL基因家族 生物信息学分析 基因表达

31772356CARS-25

2021

10.3969/j.issn.1000-1700.2021.04.001

沈阳农业大学学报
沈阳农业大学

沈阳农业大学学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.667
ISSN：1000-1700
年,卷(期)：2021.52(4)
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