摘要
各类病原体在全世界范围内影响人类健康.对病原体准确识别并获取其进化、传播等信息,有助于尽早采取适宜的防治措施.DNA测序技术的发展突破了传统病原体检测方法的局限性,可获取更多的病原体信息,有助于深入了解病原体的性质.基因序列构建的系统进化树凭借高效而准确的进化关系呈现,已成为病原学研究的重要方法.本文介绍了基于距离矩阵、序列、多位点序列分型和单核苷酸多态性算法的进化树分析和构建方法,以及在细菌、病毒、真菌和非典型病原体研究中的应用.系统进化树作为一种直观反映微生物相互关系的工具,可在物种鉴定和分型、耐药性分析、流行病学研究、微生物起源和进化、疫苗研制、病原学体监测和预警等方面为临床病原学研究提供新思路,促进对病原微生物更深层次的认知.