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基于高通量测序研究草莓根际微生物群落结构和多样性

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研究草莓根际土壤微生物群落组成和结构,对健康草莓土壤生态系统的构建和保持具有重要意义.以不同地区草莓根际土壤为研究样本,利用MiSeq平台Illumina第二代高通量测序技术并结合相关生物信息学分析土壤细菌16S rRNA基因V4+V5区域和真菌ITS1+ITS2区域的丰富度和多样性指数以及群落结构.结果表明:从15个草莓根际土壤样本中获得4554个细菌分类操作单元OTU和1298个真菌OTU,草莓根际土壤的优势细菌门为变形菌门、厚壁菌门、放线菌门、酸杆菌门和绿弯菌门,主要的优势细菌属有16种;优势真菌门为子囊菌门、接合菌门和担子菌门,主要的优势真菌属有8种.冗余分析(RDA)显示,全氮和pH对土壤微生物群落结构的影响最大,共解释了61％ 的群落变化,各因子的贡献率大小依次为土壤全氮>pH>有效磷>全钾>全磷>有机质>速效钾>碱解氮;相关性分析也表明,土壤理化指标均与不同优势菌门存在密切的相关关系.本研究结果加深了对草莓根际微生物群落结构和多样性的认识,为深入研究草莓根际微生物多样性及功能与环境因子之间的关系提供了借鉴.
Microbial Community Structures and Diversities in Strawberry Rhizosphere Soils Based on High-throughput Sequencing

赵帆、赵密珍、王钰、关玲、庞夫花

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江苏省农业科学院果树研究所/江苏省高效园艺作物遗传改良重点实验室,南京 210014

安徽大学资源与环境工程学院,合肥 230601

草莓 根际土壤 Illumina高通量测序 土壤微生物群落 土壤理化性质

江苏省现代农业研究开发示范类项目江苏省农业三新工程项目

BE2016369SXGC[2017]261

2019

土壤
中国科学院南京土壤研究所

土壤

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.052
ISSN：0253-9829
年,卷(期)：2019.51(1)
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