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番茄连作青枯病不同发病时期的非根际土壤细菌群落变化特征

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[目的]研究连作条件下番茄青枯病不同发病时期的非根际土壤微生物群落差异,明确土壤微生物对青枯病发病时期的响应机制.[方法]本研究对16SrRNAV4-V5区进行实时荧光定量PCR和高通量测序,综合分析了连续种植第1、3、5和7季的发病高峰期和发病末期的番茄非根际土壤的病原菌数量、细菌群落多样性、群落组成、标志细菌类群和群落构建机制.[结果]发病高峰期的青枯菌数量(1.28×107 copies/g)要高于发病末期(1.77×106 copies/g).随着连作时间的增加,发病时期对细菌群落多样性的影响逐渐增加.第3季和第5季不同发病时期之间的细菌群落alpha和beta多样性存在显著差异.LEfSe分析发现,番茄青枯病发病高峰期和发病末期的非根际土壤样品有其各自不同的标志细菌类群.此外,随连作时间的延长协助青枯菌致病的细菌逐渐累积.发病高峰期是微杆菌属(Microbacterium)和亚硝化螺菌属(Nitrosospira)协助青枯菌致病,而在发病末期,则由鞘脂菌属(Sphingobium)、norank_f_norank_o_SBR1031和norank_f_Rhodothermaceae协助青枯菌致病.群落构建过程分析发现不同发病时期细菌群落均以随机过程的扩散限制为主,但细菌群落在发病高峰期比发病末期的同质化作用更强.[结论]本研究发现青枯病发病高峰期和发病末期的番茄非根际土壤的细菌群落多样性、组成和结构在第3季和第5季时存在显著差异.此外,细菌群落会随着连作时间发生动态变化,而这些变化可能与细菌群落构建机制相关联.研究结果加深了对连作条件下的番茄青枯病发展过程的认识,可为防治青枯病提供参考依据.
Characteristics of bacterial community in bulk soil at different stages of tomato bacterial wilt under continuous monoculture system

侯金凤、申民翀、孙菲菲、王夏、党柯柯、刘洪、彭俊伟、刘金平、李建刚、董元华

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中国科学院南京土壤研究所,土壤环境与污染修复重点实验室,江苏南京210008

中国科学院大学,北京100049

南京市农业技术推广站,江苏南京210036

南京市蔬菜科学研究所,江苏南京210042

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番茄青枯病 连作 发病时期 细菌群落

41977055BE2021407

2022

10.13343/j.cnki.wsxb.20220020

微生物学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

微生物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.857
ISSN：0001-6209
年,卷(期)：2022.62(9)
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