微生物学报2022,Vol.62Issue(12) :4981-4991.DOI:10.13343/j.cnki.wsxb.20220232

山东地区犬冠状病毒的分子流行病学调查及其基因型多样性分析

Prevalence and genotypic diversity of canine coronavirus in Shandong Province

张传美 李文凤 张路宾 刘佳卉 单虎 杨海燕
微生物学报2022,Vol.62Issue(12) :4981-4991.DOI:10.13343/j.cnki.wsxb.20220232

山东地区犬冠状病毒的分子流行病学调查及其基因型多样性分析

Prevalence and genotypic diversity of canine coronavirus in Shandong Province

张传美 1李文凤 1张路宾 1刘佳卉 1单虎 1杨海燕1
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作者信息

  • 1. 青岛农业大学动物医学院,山东青岛266109
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摘要

[目的]了解分析山东地区健康犬及腹泻犬中犬冠状病毒(CCoV)的分子流行病学及其基因型.[方法]采集2017年以来山东省宠物市场、流浪犬中心、犬舍、各地宠物医院等的健康和腹泻犬只的肛拭子样品,采用PCR方法检测CCoV及其CCoV-Ⅰ和CCoV-Ⅱ(CCoV-Ⅱa和CCoV-Ⅱb)基因分型情况,并对扩增出的M、S全基因进行测序分析.[结果]199份样品中,共检出CCoV阳性样品79份,健康犬中的检出率为40.2%(33/82),腹泻犬中的检出率为39.3%(46/117).健康犬中CCoV-Ⅰ型与CCoV-Ⅱ型阳性检出率分别为78.8%(26/33)和51.5%(17/33);腹泻犬中CCoV-Ⅰ型与CCoV-Ⅱ型阳性检出率分别为39.13%(18/46)和80.4%(37/46).基因型阳性比率分析表明,健康犬中单独感染CCoV-Ⅰ型的比率最高,为48.5%(16/33);腹泻犬中单独感染CCoV-Ⅱa比率最高,为47.8%(22/46).测序分析获得48株M基因序列,遗传进化分析表明,12株CCoV-Ⅰ型毒株中除1株外,其余均从健康犬中分离.36株CCoV-Ⅱ型毒株中除7株来自健康犬外,其余均为腹泻犬中获得.获得的3株S全基因均来自腹泻犬且均属于CCoV-Ⅱa亚型.[结论]山东地区犬群中CCoV检出率较高,说明CCoV广泛流行,健康犬和腹泻犬中均存在多重感染情况,健康犬中主要流行CCoV毒株为CCoV-Ⅰ型,腹泻犬中主要流行CCoV-Ⅱa型.

关键词

犬冠状病毒/基因型/M基因/S基因/序列分析

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基金项目

在青高校服务青岛重点学科建设项目(025/1119002)

山东省专业学位研究生教学案例库项目(2021)(SDYAL21174)

出版年

2022
微生物学报
中国科学院微生物研究所 中国微生物学会

微生物学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.857
ISSN:0001-6209
被引量1
参考文献量3
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