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红豆杉免培养内生细菌多样性的初步研究

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[目的]了解红豆杉(Taxus chinensis)内生细菌的组成及多样性.[方法]提取红豆杉组织总DNA,选用细菌通用引物799F和1492R对总DNA进行16S rDNA特异性扩增,构建红豆杉内生细菌16S rDNA克隆文库,对阳性克隆进行PCR-RFLP(限制性内切酶片段长度多态性)分析,并对酶切带谱不同的菌液进行测序,构建系统发育树.[结果]根据酶切带谱分析和测序结果的不同,将随机挑取的158个阳性克隆归为26个不同的可操作分类单元(OUTs),系统发育分析表明这些克隆序列分别属于变形菌门(Proteobacteria,包含Alpha、Beta、Gamma、Delta亚群)、厚壁菌门(Firmicutes)、放线菌门(Actinobacteria)和拟杆菌门(Bacteroidetes)4个门.其中,变形菌门(Proteobacteria,占克隆总数的58.86％)为最优势类群.序列比对结果表明这些克隆序列分别与已报道的20个属具有较高的相似性.此外,还有一个OUTs在系统发育树上形成独立分支且未能确定其分类.[结论]红豆杉内生细菌多样性丰富,并且可能存在新的分类单元.
Culture-independent analysis of endophytic bacterial diversity in Taxus chinensis

张晶晶、兰阿峰、邓百万、陈文强、孔亚男

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陕西理工学院生物科学与工程学院 陕西汉中 723001

陕西省食药用菌工程技术研究中心 陕西汉中 723001

免培养 红豆杉 内生细菌 多样性

陕西省重点实验室研究项目陕西省教育厅项目陕西省教育厅项目

08JZ2108JK24808JK244

2013

微生物学通报
中科院微生物所 中国微生物学会

微生物学通报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：1.052
ISSN：0253-2654
年,卷(期)：2013.40(5)
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