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甘蓝型油菜HD-ZIP基因家族的鉴定和表达分析

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为揭示HD-ZIP蛋白家族成员在甘蓝型油菜全基因组中的分布及相关特征,通过生物信息学方法共鉴定出74个HD-ZIP转录因子,分别被定位到甘蓝型油菜的19条染色体和8条随机序列;这74个HD-ZIP蛋白都含有高度保守的HD-ZIP结构域;系统发育进化树将该家族成员聚为4大类;共线性分析发现大部分基因不仅在A和C染色体组间存在共线性,而且在各自染色体组内也存在串联重复事件;基因表达分析发现,大部分HD-ZIP家族基因在根和叶中均有表达,并且在根中表达的基因多于叶片,受到盐胁迫处理时,大部分基因表达量会增加.初步明确了甘蓝型油菜HD-ZIP家族成员结构特点和相关功能,为进一步研究甘蓝型油菜HD-ZIP蛋白家族基因的生物学功能奠定了基础,为油菜抗性育种工作提供科学依据.
Identification and Expression Analysis of HD-ZIP Gene Family in Brassica napus L.

昝领兄、李开祥、贾永鹏、杜德志

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青海大学农林科学院,青海省春油菜遗传改良重点实验室,国家油菜改良中心青海分中心,农业农村部春油菜科学观测实验站,青海省春油菜工程技术研究中心,西宁810016

甘蓝型油菜 HD-ZIP蛋白基因家族 差异表达

青海省春油菜遗传改良重点实验室项目青海省自然科学基金

2017-ZJ-Y092019-ZJ-972Q

2020

10.7606/j.issn.1004-1389.2020.09.008

西北农业学报
西北农林科技大学,甘肃,宁夏,青海,新疆农（林）业科学院及青海,新疆畜牧（兽医）科学院及新疆农垦科学院

西北农业学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.629
ISSN：1004-1389
年,卷(期)：2020.29(9)
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