摘要
目的 运用网络药理学及分子对接方法初步预测宣肺润燥解毒方对新型冠状病毒感染潜在机制.方法 利用中医百科全书(ETCM)及中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)收集宣肺润燥解毒方潜在活性成分及靶点,GeneCards数据库收集新型冠状病毒感染疾病靶点,Venny2.1.0 取两者交集靶点及绘制Venn图,以Cytoscape3.9.1 软件构建中药复方活性成分-靶点可视化网络;交集靶点导入 String 数据库进行蛋白质相互作用(PPI)网络分析,并基于 Cyto-scape3.9.1 绘制PPI网络图、度值(degree)参数大小TOP5 核心靶点预测互作网络图,同时DAVID数据库对交集靶点进行KEGG和GO基因集合富集分析后借助Bioinformatics微生信作图平台绘制可视化;将度值排名前5 的主要活性成分与网络拓扑分析后得到的排名前5 的核心靶点进行分子对接,AutoDock4.2.6 软件预测其分子结合自由能及Pymol2.4.1 软件作分子对接可视化图.结果 宣肺润燥解毒方治疗新型冠状病毒感染主要活性成分为槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、山柰酚、木犀草素等;重要靶点包括AKT1、TNF、IL6、VEGFA、TP53 等;GO富集得到生物过程、分子功能和细胞组分依次为329 条、59 条、46 条,KEGG通路富集得出149 条信号通路(P<0.05).槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、山柰酚、木犀草素分别与AKT1、TNF、IL6、VEGFA、TP53、ACE2、3CLpro对接结合能均<-5.00 kcal/mol.结论 宣肺润燥解毒方治疗新型冠状病毒感染可能是通过主要活性成分槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇、山柰酚、木犀草素等有效成分作用于AKT1、TNF、IL6、VEGFA、TP53 等核心靶点调控AGE-RAGE信号通路、IL-17 信号通路、TNF信号通路、Toll样受体信号通路、C型凝集素受体信号通路等发挥作用,从而发挥抗病毒,调节机体免疫,减少炎症反应对组织的损伤等功效以治疗新型冠状病毒感染.
基金项目
广东省中医药局科研项目(20232002)
广东省省级科技计划项目(2018B020207009)
维普
万方数据