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PRRSV HNHK3-2021毒株的ORF5和ORF7序列分析

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[目的]研究海南猪繁殖与呼吸综合征病毒PRRSV的流行病学特征和遗传变异规律。[方法]采集海南省海口市及周边地区样品，分离出PRRSV HNHK3-2021 毒株，并测定NSP2 基因以及 ORF5 和ORF7 基因序列，采用Lasergene 7。1 进行序列比对分析，用 MEGA-X 进行遗传演化分析。[结果]分离出的 PRRSV HNHK3-2021 株为美洲型毒株，PRRSV HNHK3-2021 株和EF112447 HEB1、EU109503 GD、EU624117 XH-GD的ORF5 和ORF7 的核苷酸相似性较高，分别为99。2%～99。3%和 99。5%～100%，推导氨基酸相似性为99%～99。5%和 100%;PRRSV HNHK3-2021 株和 EU864232 SHB、AY262352_HB-2(sh)2002、AY656990 Abst-1、AY032626 CH-1a、EU807840 CH-1R 的 ORF5 和 ORF7 的核苷酸相似性为 87。1%～96。4%和91。4%～97。3%，推导氨基酸的相似性为 86。6%～93%和 91。9%～97。6%;PRRSV HNHK3-2021 株和JN654459 NADC30、KP860909 FJZ03、MH068878 SD17-38、AY881994 FJ-1 的ORF5 和ORF7 的核苷酸相似性为85。4%～87。1%和 89%～91。4%。氨基酸的相似性为 86。1%～87。1%和 89。5%～91。9%。[结论]RRSV HNHK3-2021 毒株和EU624117 XH-GD具有最近的遗传距离。
Sequence analysis of ORF3 and ORF5 of PRRSV HNHK3-2021 strain isolated in Hainan
[Objective]To explore the epidemiological characteristics and genetic variation of PRRSV in Hainan.[Methods]Samples were collected from Haikou and surrounding areas.The PRRSV strain HNHK3-2021 was isolated,and the NSP2 genes,as well as the ORF5 and ORF7 gene sequences,were deter-mined.Sequence alignment analysis was conducted using Lasergene 7.1,and genetic evolution analysis was performed using MEGA-X.[Results]The PRRSV HNHK3-2021 strain isolated was found to be of Ameri-can origin with high nucleotide similarity to EF112447 HEB1,EU109503 GD,and EU624117 XH-GD ORF5 and ORF7(99.2%-99.3%and 99.5%-100%,respectively).The derived amino acid similarity was 99%-99.5%and 100%.The nucleotide similarities of ORF5 and ORF7 of PRRSV HNHK3-2021 strain and EU864232 SHB,AY262352_HB-2(sh)2002,AY656990 Abst-1,AY032626 CH-1a,EU807840 CH-1R were found to be 87.1%-96.4%and 91.4%-97.3%,respectively.Similarly,the similarity of amino acids was 86.6%-93%and 91.9%-97.6%.The nucleotide similarities of ORF5 and ORF7 of PRRSV HNHK3-2021 strain and JN654459 NADC30,KP860909 FJZ03,MH068878 SD17-38,AY881994 FJ-1 were found to be 85.4%-87.1%and 89%-91.4%.The similarity of amino acids was 86.1%-87.1%and 89.5%-91.9%.[Conclusion]The PRRSV HNHK3-2021 strain and EU624117 XH-GD have the closest genetic distance.

porcine reproductive and respiratory syndromegenetic evolution analysisORF5ORF7

范悦轩、马佳镁、黄春媛、郑佳馨、陈素贞、张艳、刘光亮、曹宗喜

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新疆农业大学动物医学学院,乌鲁木齐 830000

海南省农业科学院畜牧兽医研究所/海南省热带动物繁育与疫病研究重点实验室,海口 571100

海南省农业科学院畜牧兽医研究所海南省院士团队创新中心,海口 571100

猪繁殖与呼吸综合征 遗传进化 ORF5 ORF7

海南省省属科研院所技术创新专项国家自然科学基金项目家畜疫病病原生物学国家重点实验室开放基金海南省农业科学院院本级科研项目国家重点研发计划

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ISSN：1001-4330
年,卷(期)：2024.61(5)
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