新疆农业科学2024,Vol.61Issue(7) :1778-1785.DOI:10.6048/j.issn.1001-4330.2024.07.026

一株海洋杆菌属新菌种XAAS-72T的植物促生功能分析及ACC脱氨酶蛋白结构预测

Structure prediction of the ACC protein from Pontibacter kalidii XAAS-72T with the plant growth-promoting character

王慧楠 朱静 谢文文 何子璇 柏晓玉 朱艳蕾 张志东
新疆农业科学2024,Vol.61Issue(7) :1778-1785.DOI:10.6048/j.issn.1001-4330.2024.07.026

一株海洋杆菌属新菌种XAAS-72T的植物促生功能分析及ACC脱氨酶蛋白结构预测

Structure prediction of the ACC protein from Pontibacter kalidii XAAS-72T with the plant growth-promoting character

王慧楠 1朱静 2谢文文 3何子璇 3柏晓玉 4朱艳蕾 4张志东5
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作者信息

  • 1. 新疆师范大学生命科学学院,乌鲁木齐 8300541;新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物实验室,乌鲁木齐 830091
  • 2. 新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物实验室,乌鲁木齐 830091
  • 3. 新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物实验室,乌鲁木齐 830091;新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐 830046
  • 4. 新疆师范大学生命科学学院,乌鲁木齐 8300541
  • 5. 新疆师范大学生命科学学院,乌鲁木齐 8300541;新疆农业科学院微生物应用研究所/新疆特殊环境微生物实验室,乌鲁木齐 830091;新疆大学生命科学与技术学院,乌鲁木齐 830046
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摘要

[目的]研究海洋杆菌属新菌种XAAS-72的植物促生功能,挖掘其潜在功能基因.[方法]通过对菌株全基因组测序,分析相关功能基因组成,挖掘ACC脱氨酶合成相关的候选基因,并进行功能预测.[结果]海洋杆菌属新种Pontibacter kalidii XAAS-72菌悬液处理可显著提高盆栽小麦麦苗生长,其基因组长度为5 054 860 bp,含1个环形质粒,总GC含量为54.52%,注释的基因数目为4 391个,编码蛋白数4 261个,具有多种抗逆和促生相关基因.其与 Pontibacter sp.BAB1700 的 ACC 脱氨酶(1-aminoeyclopropane-1-earboxy-late-deaminase)相似度最高为72.48%.该蛋白属于不稳定亲水性蛋白,不具备跨膜结构,且无信号肽结构.[结论]海洋杆菌属新种XAAS-72蕴藏着丰富的抗逆和植物促生相关基因.

Abstract

[Objective]To explore the plant growth promotion function of a novel strain Pontibacter kalidii XAAS-72T,and investigate the potential functional genes.[Methods]The strain whole genome was se-quenced,and the composition of function genes were analyzed.A candidate gene related to ACC deaminase synthesis was obtained,and the enzyme protein characteristics were predicted.[Results]The results showed that the growth of wheat seed treated with Pontibacter kalidii XAAS-72T was promoted significantly in pots.The genome length of strain XAAS-72(accession no.CP1 11079)was 5,054,860 bp,containing one circular plasmid.A total GC content was 54.52%,and the number of annotated genes was 4,391,coding for 4,261 proteins.A variety of resistance and growth-promoting related genes was observed.It had the highest similarity of 72.48%to the ACC deaminase of Pontibacter sp.BAB1700.It an unstable hydrophilic protein,with none of transmembrane structure and signal peptide structure.[Conclusion]Pontibacter kalidii XAAS-72T harbors a lot of genes related to the stress resistance and the plant growth-promoting.

关键词

海洋杆菌属/植物促生特性/ACC脱氨酶/结构预测

Key words

Pontibacter/plant growth-promoting character/ACC deaminase/structure prediction

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基金项目

新疆维吾尔自治区自然科学基金项目"杰出青年基金"(2022D01E19)

新疆农业科学院科技创新重点培育专项(xjkcpy-2022004)

新疆农业科学院农业科技创新稳定支持专项(xjnkywdzc-2023005)

出版年

2024
新疆农业科学
新疆农业科学院 新疆农业大学 新疆农学会

新疆农业科学

CSTPCD北大核心
影响因子:0.698
ISSN:1001-4330
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