摘要
旨在比较简化基因组测序技术和基因芯片技术实施基因组选择的基因组估计育种值(GEBV)准确性.本研究在AH肉鸡资源群体F2代中随机选取395个个体(其中公鸡212只,母鸡183只,来自8个半同胞家系),同时采用10×SLAF测序技术和Illumina Chicken 60K SNP芯片进行基因标记分型.采用基因组最佳无偏估计法(GBLUP)和BayesCπ对6周体重、12周体重、日均增重、日均采食量、饲料转化率和剩余采食量等6个性状进行GEBV准确性比较研究,并采用5折交叉验证法验证.结果 表明,采用同一基因标记分型平台,两种育种值估计方法所得GEBV准确性差异不显著(P＞0.05);不同的性状对基因标记分型平台的选择存在差异,对于6周体重,使用基因芯片可获得更高的GEBV准确性(P＜0.05),对于剩余采食量,则使用简化基因组测序可获得更高的GEBV准确性(P＜0.05).综合6个性状GEBV均值比较,两个基因标记分型平台之间差异不到0.01,高通量测序技术和基因芯片技术都可以用于黄羽肉鸡基因组选择.
基金项目
广东省科技计划项目(2017B020201006)
广东省科技计划项目(2017B020232003)
广东省自然科学基金(2020A1515011277)
现代产业技术体系岗位科学家专项(CARS-41)
广东省现代农业产业技术体系创新团队(2019KJ128)
科技创新战略专项资金(R2017PY-QY007)
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