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水貂酪氨酸酶(TYR)基因克隆、SNPs筛查及其皮肤组织mRNA差异表达分析

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旨在克隆和分析水貂酪氨酸酶(tyrosinase,TYR)基因编码区,揭示该基因编码区SNPs及其皮肤组织mRNA差异表达规律与水貂毛色表型的关系.本研究采集7月龄雄性金州黑水貂、名威银蓝水貂和红眼白水貂共计301个样本的血液,利用聚合酶链式反应(PCR)方法对水貂TYR基因5个外显子进行分段克隆,并拼接获得其完整编码区序列(coding sequence,CDS);采用PCR产物直接测序技术筛查3种毛色水貂外显子1、4和5中的SNPs;采集9只7月龄雄性水貂(黑、灰与白色被毛各3只)背中部皮肤组织,通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术检测TYR基因mRNA在3种毛色水貂皮肤组织中的表达水平.结果表明,克隆的水貂TYR基因序列长2 391 bp,由5个外显子组成,编码区长1 596 bp,编码的531个氨基酸中包括信号肽(18个氨基酸)和成熟肽(513个氨基酸),该序列已上传GenBank(KJ716783).SNPs筛查发现,3种毛色水貂TYR基因外显子4和5不存在突变位点,外显子1发现2处变异:c.441G＞A和c.138T＞A,c.441G＞A为同义突变且仅存在于金州黑水貂群体.qRT-PCR分析显示,TYR基因mRNA在3种毛色水貂皮肤组织中均表达,且在金州黑水貂中的表达极显著高于银蓝水貂和红眼白水貂(P＜0.01),在银蓝水貂中的表达显著高于红眼白水貂(P＜0.05).研究结果提示,TYR基因c.138T＞A位点及其皮肤组织mRNA差异表达水平与水貂毛色显著关联.
Cloning,SNPs Screening and mRNA Differential Expression Analysis of TYR Gene in Skin of Mink(Neovison vison)

宋兴超、刘琳玲、潘虹军、赵家平、贾赟、杨福合、徐超

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铜仁学院,铜仁554300

中国农业科学院特产研究所,长春130112

大连海关技术中心,大连116001

水貂 酪氨酸酶基因 单核苷酸多态性 毛色性状 差异表达 皮肤

中国科协青年人才托举工程吉林省科技发展计划吉林省科技发展计划中国农业科学院科技创新工程中央级公益性科研院所基本科研业务费专项

2017QNRC00120180520032JH20190301048NYCAAS-ASTIP-2020-ISAPS1610342017011

2021

10.11843/j.issn.0366-6964.2021.01.007

畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.729
ISSN：0366-6964
年,卷(期)：2021.52(1)
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