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湖羊PLAG1基因5'调控区多态性及其与早期体重的关联分析

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旨在克隆湖羊PLAG1基因5'调控区序列,明确PLAG1基因5'调控区多态性与湖羊早期体重的关系,寻找用于湖羊生长性状辅助选择的分子标记.本研究利用5'RACE技术鉴定PLAG1基因转录起始位点,以456只断奶湖羊为对象,利用测序法筛选PLA G1 5'调控区SNP位点,使用SPSS 18.0软件分析不同基因型对湖羊初生体重和断奶体重的影响.结果表明,PLAG1基因转录起始位点均位于g.30535位点,测序发现,PLAG1基因5'调控序列存在15个SNPs位点,在湖羊群体中均有3种基因型,均处于Hardy-Weinberg平衡状态.关联分析发现,g.28888A>T位点AA 型、g.28901G>T 位点GG 型、g.30802C>T 位点CC 型、g.30825A>G 位点AA 型的初生体重均显著大于相应的杂合基因型(P<0.05),g.30737T>C位点CC型断奶体重显著小于TC型(P<0.05).连锁分析发现,g.28888A>T、g.28901G>T、g.28913T>A、g.29717G>C、g.29724A>C、g.29725G>A、g.29768T>C、g.29771A>G、g.30141T>A、g.30144A>G、g.30691C> A、g.30694A>T、g.30737T>C、g.30802C> T、g.30825A>G,15个位点连锁且有18种单倍型.将样本量较多的5种单倍型与湖羊早期体重进行关联分析发现,AAGGTAGGAAGGTTAATTAACCAATCCCAA 单倍型初生体重显著大于ATGTTAGCACGATCAGTAAG-CAATTCCTAG 单倍型(P<0.05),断奶体重显著大于AAGGAAGGAAGGTTAATTAACCAACCCCAA 单倍型(P<0.05).上述结果表明,湖羊群体中PLAG1基因5'调控区存在15个连锁的SNPs位点,其中g.28888A>T、g.28901G>T、g.30802C>T、g.30825A>G位点与初生体重显著相关(P<0.05),g.30737T>C位点与断奶体重显著相关(P<0.05),AAGGTAGGAAGGTTAATTAACCAATCCCAA单倍型与初生体重和断奶体重显著相关(P<0.05),说明PLAG1基因可作为湖羊生长性状选择的候选遗传标记.
Polymorphisms in the 5'Regulatory Region of PLAG1 Gene and Their Association with Early Body Weight of Hu Sheep

郭潇潇、李隐侠、王悦、张含、张俊、钱勇、孟春花、王慧利、仲跻峰、曹少先

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南京农业大学动物科技学院,南京210095

江苏省农业科学院畜牧研究所,南京210014

江苏省农业种质资源保护与利用平台,南京210014

湖羊 PLAG1基因 5'调控区 SNPs 初生体重 断奶体重

江苏省重点研发计划(现代农业)重点项目江苏省农业科技自主创新资金

BE2019373CX183004

2021

畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.729
ISSN:0366-6964
年,卷(期):2021.52(2)
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