畜牧兽医学报2021，Vol.52Issue(2) ：331-343.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.02.006

湖羊PLAG1基因5'调控区多态性及其与早期体重的关联分析

Polymorphisms in the 5'Regulatory Region of PLAG1 Gene and Their Association with Early Body Weight of Hu Sheep

郭潇潇 李隐侠 王悦 张含 张俊 钱勇 孟春花 王慧利 仲跻峰 曹少先
畜牧兽医学报2021，Vol.52Issue(2) ：331-343.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.02.006
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湖羊PLAG1基因5'调控区多态性及其与早期体重的关联分析

Polymorphisms in the 5'Regulatory Region of PLAG1 Gene and Their Association with Early Body Weight of Hu Sheep

郭潇潇 1李隐侠 2王悦 3张含 3张俊 3钱勇 3孟春花 3王慧利 3仲跻峰 3曹少先4
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作者信息

  • 1. 南京农业大学动物科技学院,南京210095;江苏省农业科学院畜牧研究所,南京210014
  • 2. 江苏省农业科学院畜牧研究所,南京210014;江苏省农业种质资源保护与利用平台,南京210014
  • 3. 江苏省农业科学院畜牧研究所,南京210014
  • 4. 南京农业大学动物科技学院,南京210095;江苏省农业科学院畜牧研究所,南京210014;江苏省农业种质资源保护与利用平台,南京210014
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摘要

旨在克隆湖羊PLAG1基因5'调控区序列,明确PLAG1基因5'调控区多态性与湖羊早期体重的关系,寻找用于湖羊生长性状辅助选择的分子标记.本研究利用5'RACE技术鉴定PLAG1基因转录起始位点,以456只断奶湖羊为对象,利用测序法筛选PLA G1 5'调控区SNP位点,使用SPSS 18.0软件分析不同基因型对湖羊初生体重和断奶体重的影响.结果表明,PLAG1基因转录起始位点均位于g.30535位点,测序发现,PLAG1基因5'调控序列存在15个SNPs位点,在湖羊群体中均有3种基因型,均处于Hardy-Weinberg平衡状态.关联分析发现,g.28888A＞T位点AA 型、g.28901G＞T 位点GG 型、g.30802C＞T 位点CC 型、g.30825A＞G 位点AA 型的初生体重均显著大于相应的杂合基因型(P＜0.05),g.30737T＞C位点CC型断奶体重显著小于TC型(P＜0.05).连锁分析发现,g.28888A＞T、g.28901G＞T、g.28913T＞A、g.29717G＞C、g.29724A＞C、g.29725G＞A、g.29768T＞C、g.29771A＞G、g.30141T＞A、g.30144A＞G、g.30691C＞ A、g.30694A＞T、g.30737T＞C、g.30802C＞ T、g.30825A＞G,15个位点连锁且有18种单倍型.将样本量较多的5种单倍型与湖羊早期体重进行关联分析发现,AAGGTAGGAAGGTTAATTAACCAATCCCAA 单倍型初生体重显著大于ATGTTAGCACGATCAGTAAG-CAATTCCTAG 单倍型(P＜0.05),断奶体重显著大于AAGGAAGGAAGGTTAATTAACCAACCCCAA 单倍型(P＜0.05).上述结果表明,湖羊群体中PLAG1基因5'调控区存在15个连锁的SNPs位点,其中g.28888A＞T、g.28901G＞T、g.30802C＞T、g.30825A＞G位点与初生体重显著相关(P＜0.05),g.30737T＞C位点与断奶体重显著相关(P＜0.05),AAGGTAGGAAGGTTAATTAACCAATCCCAA单倍型与初生体重和断奶体重显著相关(P＜0.05),说明PLAG1基因可作为湖羊生长性状选择的候选遗传标记.

关键词

湖羊/PLAG1基因/5'调控区/SNPs/初生体重/断奶体重

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基金项目

江苏省重点研发计划(现代农业)重点项目(BE2019373)

江苏省农业科技自主创新资金(CX183004)

出版年

2021
畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.729
ISSN：0366-6964
被引量1
参考文献量2
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