畜牧兽医学报2021,Vol.52Issue(2) :460-468.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.02.018

牛结节性皮肤病病毒感染MDBK细胞后转录组差异表达分析

Transcriptome Analysis of MDBK Cells Infected with Lumpy Skin Disease Virus

曹政 居马别克·夏拉巴依 李春燕 马力克·艾则孜
畜牧兽医学报2021,Vol.52Issue(2) :460-468.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.02.018

牛结节性皮肤病病毒感染MDBK细胞后转录组差异表达分析

Transcriptome Analysis of MDBK Cells Infected with Lumpy Skin Disease Virus

曹政 1居马别克·夏拉巴依 2李春燕 3马力克·艾则孜2
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作者信息

  • 1. 重庆市畜牧科学院,重庆402460
  • 2. 新疆维吾尔自治区动物卫生监督所,乌鲁木齐830011
  • 3. 陆军军医大学第一附属医院全军临床病理学研究所,重庆400000
  • 折叠

摘要

旨在探索牛结节性皮肤病病毒(lumpy skin disease virus,LSDV)与宿主细胞的相互作用,采集了具有典型临床症状的牛皮肤病变组织,接种MDBK细胞进行病毒分离,采用透射电镜观察病变组织及病毒感染后的MDBK细胞,同时对感染后24 h的MDBK细胞进行转录组学分析,筛选差异表达基因并将其按功能分类,分析它们参与的细胞信号通路.结果显示,LSDV在电镜下呈椭圆形,病毒粒子大小约320 nmX260 nm.转录组分析发现,与未处理组相比,显著差异表达的基因共499个,其中,112个基因上调表达,387个基因下调表达.通过GO和KEGG分析得知,差异表达基因主要富集在从细胞表面传导信号至细胞核内部的MAPK信号通路,其中,参与天然免疫且涉及细胞凋亡的MAP3K1基因表达呈现显著下调,提示病毒感染会影响宿主细胞的迁移与凋亡等过程.显著变化基因包括HIF1A、RORA、LRRK2、AP3B1和ANO6等,分别涉及到调节血管内皮生长因子、炎症反应、细胞增殖分化以及信号转导等功能,除此之外,不饱和脂肪酸及胆汁分泌两个信号通路也发生了显著变化.本研究为进一步深入探究LSDV的致病机制奠定了基础.

关键词

牛结节性皮肤病病毒/MDBK细胞/高通量测序/转录组

引用本文复制引用

基金项目

科研机构绩效引导专项(CSSA2019ZN038)

出版年

2021
畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.729
ISSN:0366-6964
被引量3
参考文献量3
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