畜牧兽医学报2021,Vol.52Issue(2) :469-477.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.02.019

牦牛源牛凸隆病毒的检测及其基因组特征

Detection and Genomic Characteristics of Bovine Torovirus in Yak

赵龙 汤承 岳华
畜牧兽医学报2021,Vol.52Issue(2) :469-477.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.02.019

牦牛源牛凸隆病毒的检测及其基因组特征

Detection and Genomic Characteristics of Bovine Torovirus in Yak

赵龙 1汤承 2岳华2
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作者信息

  • 1. 西南民族大学畜牧兽医学院,成都610041
  • 2. 西南民族大学畜牧兽医学院,成都610041;青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,成都610041
  • 折叠

摘要

本研究旨在证实青藏高原牦牛中牛凸隆病毒(bovine torovirus,BToV)的存在,并分析其基因组特征.采用RT-PCR方法检测西藏、青海、四川藏区的犊牦牛腹泻粪便中BToV,并扩增基因组.结果从145份样本中检出10份BToV阳性,平均阳性率约为6.9%,其中西藏、青海、四川藏区的阳性率分别约为11.8%、8.9%、3.0%.成功获得1个长为28 314 bp的牦牛源BToV基因组,GC含量为36.31%,与GenBank中已有的5个BToV基因组的核苷酸相似性为82%~97%,与国内BToV基因组SC2的相似性最高且遗传关系最近.本研究中BToV基因组的S基因与GenBank中已有的14个完整BToV-S基因相比,存在8个独特的氨基酸变异,其中,6个位于S1结构域,2个位于S2结构域,且在222-2 473 bp发生区域重组事件.本研究证明BToV在牦牛中的存在,并且地域分布广泛,获得了牦牛源Ⅲ型BToV基因组,报道了BToV的S基因重组事件,有助于进一步了解BToV的分子特征和遗传进化.

关键词

牦牛/牛凸隆病毒/基因组/S基因重组

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基金项目

西南民族大学新发动物疫病创新团队(2020 NTD02)

国家民委领军人才支持计划()

四川省肉牛创新团队项目()

出版年

2021
畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.729
ISSN:0366-6964
被引量3
参考文献量7
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