本研究旨在证实青藏高原牦牛中牛凸隆病毒(bovine torovirus,BToV)的存在,并分析其基因组特征.采用RT-PCR方法检测西藏、青海、四川藏区的犊牦牛腹泻粪便中BToV,并扩增基因组.结果从145份样本中检出10份BToV阳性,平均阳性率约为6.9％,其中西藏、青海、四川藏区的阳性率分别约为11.8％、8.9％、3.0％.成功获得1个长为28 314 bp的牦牛源BToV基因组,GC含量为36.31％,与GenBank中已有的5个BToV基因组的核苷酸相似性为82％～97％,与国内BToV基因组SC2的相似性最高且遗传关系最近.本研究中BToV基因组的S基因与GenBank中已有的14个完整BToV-S基因相比,存在8个独特的氨基酸变异,其中,6个位于S1结构域,2个位于S2结构域,且在222-2 473 bp发生区域重组事件.本研究证明BToV在牦牛中的存在,并且地域分布广泛,获得了牦牛源Ⅲ型BToV基因组,报道了BToV的S基因重组事件,有助于进一步了解BToV的分子特征和遗传进化.
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