首页|1株塞内卡病毒A型的基因组序列与演化分析

1株塞内卡病毒A型的基因组序列与演化分析

扫码查看
原文链接
  • 国家科技期刊平台
  • NETL
  • NSTL
  • 万方数据
  • 维普
旨在分析塞内卡病毒A型(Senecavirus A,SVA)CH-HNCY-2019株的基因组特性和演化,参考SVA毒株SVV-001(GenBank No.NC011349)全基因组序列设计8对引物,通过RT-PCR扩增和测序获得SVA CH-HNCY-2019株全基因序列并进行序列分析.结果显示,SVA分离株CH-HNCY-2019基因组全长为7 294个核苷酸,与中国分离株核苷酸相似性为95.9％〜99％,与美国经典株SVV-001核苷酸相似性最低.CH-HNCY-2019与大多数中国2017-2018年分离毒株亲缘关系较近,处于同一分支,而与中国2015-2016年分离株亲缘关系较远.与包括2019年中国广东4个SVA分离株在内的其他国内外分离株相比,CH-HNCY-2019的VP1蛋白的722位氨基酸由L突变为Q;VP3蛋白的499位氨基酸由A突变为V,528位氨基酸由P突变为S,582位氨基酸由E突变为K.本研究成功获得1株SVA CH-HNCY-2019全基因组序列,研究结果提示,SVA中国流行株具有多样性,而且在不断地演变,应加强SVA的分子流行病学调查、生物安全措施和疫苗研发以防止SVA在我国猪群中的广泛传播.
Genome Sequencing and Phylogenetic Analysis of Senecavirus A,CH-HNCY-2019

李宁、郭慧芳、王白玉、乔麒龙、黄庆、李永涛、王增、赵军

展开 >

河南农业大学牧医工程学院,郑州450046

塞内卡病毒A RT-PCR扩增 SVA CH-HNCY-2019 基因组序列分析 遗传进化

国家重点研发计划资助项目

2016YFD0501100

2021

10.11843/j.issn.0366-6964.2021.02.028

畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.729
ISSN：0366-6964
年,卷(期)：2021.52(2)
  • 1
  • 4