畜牧兽医学报2021,Vol.52Issue(3) :809-819.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.03.025

基于网络药理学和分子对接分析苦参碱抗PRRSV的作用机制

A Study on Mechanism of Matrine against PRRSV Based on Network Pharmacology and Molecular Docking

郝江花 孙娜 孙盼盼 孙耀贵 范阔海 尹伟 李宏全
畜牧兽医学报2021,Vol.52Issue(3) :809-819.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.03.025

基于网络药理学和分子对接分析苦参碱抗PRRSV的作用机制

A Study on Mechanism of Matrine against PRRSV Based on Network Pharmacology and Molecular Docking

郝江花 1孙娜 1孙盼盼 2孙耀贵 1范阔海 2尹伟 1李宏全1
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作者信息

  • 1. 山西农业大学动物医学学院,太谷030801
  • 2. 山西农业大学实验动物管理中心,太谷030801
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摘要

本研究旨在利用网络药理学及分子对接技术从抗炎角度探讨苦参碱抗猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的作用机制.利用PharmMapper 服务器和Genecards疾病数据库获得苦参碱发挥抗炎作用的潜在靶点;使用STRING在线分析平台结合Cytoscape软件构建靶蛋白相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络并进行拓扑学分析筛选关键靶点;利用DAVID数据库对靶点进行基因本体论GO富集分析以及KEGG通路富集分析,并使用Cytoscape软件进行"药物-靶点-通路"网络图的构建;使用Autodock Vina软件进行分子对接,选择最佳的结合靶点.网络分析结果表明,苦参碱抗炎的潜在靶点有23个;蛋白互作网络提示,IGFⅠ、MAPK8、CASP3、NR3C1可能是苦参碱抗炎的核心靶点;GO富集分析得到116个细胞生物学过程,KEGG通路富集分析得到47条相关信号通路;分子对接显示,MAPK8与苦参碱有较好亲和力,可能是苦参碱发挥抗炎作用的主要靶点.苦参碱可能通过作用于MAPK8这一关键蛋白发挥抗炎作用,进而达到抗PRRSV的作用.

关键词

苦参碱/网络药理学/抗炎/靶点

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基金项目

出版年

2021
畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.729
ISSN:0366-6964
被引量2
参考文献量10
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