畜牧兽医学报2021,Vol.52Issue(4) :1069-1078.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.04.022

1株C3样奇异变形杆菌烈性噬菌体的生物学特性及基因组分析

Biological Characteristics and Genomic Analysis of a Lytic Proteus mirabilis Phage with C3Morphotype

李淑雅 黄赞 朱伟云 林焱
畜牧兽医学报2021,Vol.52Issue(4) :1069-1078.DOI:10.11843/j.issn.0366-6964.2021.04.022

1株C3样奇异变形杆菌烈性噬菌体的生物学特性及基因组分析

Biological Characteristics and Genomic Analysis of a Lytic Proteus mirabilis Phage with C3Morphotype

李淑雅 1黄赞 1朱伟云 1林焱1
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作者信息

  • 1. 国家动物消化道营养国际联合研究中心,江苏省消化道营养与动物健康重点实验室,南京农业大学消化道微生物研究室,南京210095
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摘要

从仔猪粪样中分离鉴定奇异变形杆菌(Proteus mirabilis)的烈性噬菌体,并对其进行生物学特性分析和基因组分析.以Proteus mirabilis为宿主菌,用双层平板法从仔猪粪样中分离噬菌体.利用电子显微镜观察噬菌体大小和形态.提取噬菌体DNA,并使用Illumina Hiseq进行高通量测序,对基因组进行注释和分析.结果显示:分离到的奇异变形杆菌噬菌体命名为vB_PmiP_P59(Proteus mirabilis phage vB_PmiP_P59).P59属于短尾噬菌体科,形态为C3形:头部为扁平的椭圆形,长152nm,宽54nm;尾部长约40nm,宽12nm.P59的最佳感染复数为0.001;潜伏期为30 min,爆发期为105 min,裂解量为2754PFU·cell-1;P59在不高于50℃,pH 5~10时稳定.P59噬菌体基因组全长90187bp,(G+C)%含量为34.65%,共编码136个ORF和4个tRNA,不携带抗生素抗性基因和毒力基因.蛋白质组分析表明,P59与C3样噬菌体phiEco32有30.47%的一致性.奇异变形杆菌噬菌体vB_PmiP_P59属于C3样烈性噬菌体,并对奇异变形杆菌有显著的抑菌效果.

关键词

奇异变形杆菌/噬菌体/C3/生物学特性/基因组学

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基金项目

出版年

2021
畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.729
ISSN:0366-6964
被引量2
参考文献量5
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