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奶牛养殖场环境大肠杆菌的ERIC-PCR分型和系统进化分群

ERIC-PCR Genotyping and Phylogenetic Grouping of Escherichia coli from a Dairy Farm Environment

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旨在了解奶牛养殖场环境中大肠杆菌流行情况及遗传多样性,探究不同样品分离菌株的遗传关系及系统进化分群情况,收集2017-2019年新疆某大型奶牛场养殖环境中的209份样品进行大肠杆菌分离和16S rRNA鉴定,对非重复菌株进行ERIC-PCR分型和系统进化分群试验.结果显示,共分离到338株大肠杆菌,分离率为67.46％.ERIC-PCR将其分为Ⅰ～Ⅹ Ⅳ共14型.Ⅳ(196株)型为优势型;其次为Ⅰ型(59株)、V(31株)、Ⅹ(11株);剩余41株分布于其他10种型.除2株未分群外,其他被分为6个群,B1群(75.45％)分布最多,其次是A群(18.34％)、C群(2.96％)、D或E群(1.18％)、F群(0.30％).综上表明,奶牛养殖场环境中大肠杆菌存在广泛的DNA多样性,且不同时间及来源菌株间存在较近的亲缘关系;系统进化分群以B1群为主.

何卓琳、唐敏嘉、张雪婧、侯晓、蒲万霞

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中国农业科学院兰州畜牧与兽药研究所农业农村部兽用药物创制重点实验室甘肃省新兽药工程重点实验室,兰州730050

大肠杆菌 奶牛养殖场环境 ERIC-PCR 系统进化分群

2016YFD050130525-LZIHPS-03

2021

10.11843/j.issn.0366-6964.2021.07.028

畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.729
ISSN：0366-6964
年,卷(期)：2021.52(7)
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