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戴瑞奶绵羊产奶性状的全基因组关联分析

Genome-wide Association Study of Milk Production Traits in Dairy Meade Sheep

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旨在通过对奶绵羊产奶性状的全基因组关联分析(GWAS),寻找和定位与奶绵羊产奶性状相关的遗传标记和功能基因.本研究以135只戴瑞奶绵羊为试验材料,基于全基因组重测序技术,通过SAM TOOLS进行单核苷酸多态性(SNP)检测,使用PLINK v1.90进行质控,利用GEMMA v0.98.1的混合线性模型对质控结果进行奶绵羊产奶性状相关的全基因组关联分析.结果表明,有1个SNP与泌乳后90天日均产奶量在全基因组范围内显著相关,8个SNPs达到潜在显著关联,相关的候选基因包括TRNAQ-CUG-2、LOC114117240、ACADL、MYL1、CHD6、SLCO3A1;有2个SNPs与150天日均产奶量达潜在显著关联,相关的候选基因包括PRMT6、RNF180;有2个SNPs与泌乳周期达潜在显著关联,相关的候选基因包括PRMT6、TRNAW-CCA-68、TRNASGGA-61.进一步基因功能分析推测,ACADL、SLCO3A1可能是影响奶绵羊产奶性状的候选基因.本研究为奶绵羊产奶性状的分子机制解析提供了一定的基础,为我国奶绵羊新品种培育提供了一定的理论参考.

米布农、张立果、乌日汉、郭玉林、王春伟、徐全忠、冯爽、李光鹏、苏小虎、张立

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内蒙古大学生命科学学院省部共建草原家畜生殖调控与繁育国家重点实验室,呼和浩特010020

乌兰察布市农牧局乌兰察布市家畜畜牧工作站,乌兰察布012000

全基因组关联分析 戴瑞奶绵羊 产奶性状 重测序 候选基因

内蒙古自治区科技重大专项内蒙古大学省部共建草原家畜生殖调控与繁育国家重点实验室开放基金

30900-5173910SKY-IT-201811

2021

10.11843/j.issn.0366-6964.2021.011.030

畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.729
ISSN：0366-6964
年,卷(期)：2021.52(11)
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