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四川盆地6个地方鸡群体遗传关系研究

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随着交通便利与市场化杂交利用,我国地方鸡遗传资源面临血液混杂、品种来源和品种间的遗传关系不清晰的问题.为了给第三次全国畜禽遗传资源普查工作提供依据.本研究对位于中国大巴山脉和乌蒙山区的6个地方鸡群体(每个群体公、母各10只)共118个个体进行了简化基因组GBS测序,分析了核酸多态性(Pi)、观测杂合度(Ho)、期望杂合度(He)、多态信息含量(PIC)、观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、遗传分化(Fst)、遗传距离(DR)和基因流(Nm)等指标.研究发现,岩水鸡黑羽群体的遗传多样性较低(He=0.154;PIC=0.125),大宁河鸡遗传多样性最为丰富(He=0.197,PIC=0.162).城口山地鸡和大宁河鸡之间的遗传分化最低(Fst=0.053),基因流最高(Nm=4.50),丰岩乌骨鸡和岩水鸡黑羽群体之间的遗传分化最高(Fst=0.183),对应的基因流最低(Nm=1.12).系统发生树和主成分分析显示,岩水鸡白羽群体和黑羽群体聚为一类,城口山地鸡、大宁河鸡和旧院黑鸡聚为一类,丰岩乌骨鸡单独为一类.Structure分析表明,城口山地鸡与岩水鸡白羽群体血缘混杂.本研究探明了邻近区域地方品种的遗传关系,位于乌蒙山区的丰岩乌骨鸡与大巴山脉的旧院黑鸡、城口山地鸡、大宁河鸡、岩水鸡黑羽和白羽具有较远的遗传距离.本研究为地方品种的保护和开发利用提供了依据.
Study on the Genetic Relationship of Six Local Chicken Populations from Sichuan Basin

尤桂爽、易兴友、蒋美山、李中伟、谭和林、曹池、舒刚、田尧夫、朱庆、赵小玲

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四川农业大学动物科技学院,成都611130

重庆市开州区农业发展服务中心,重庆405499

地方鸡品种 遗传多样性 简化基因组 基因流 系统发生树

重庆市开州区农业农村委员会专项2020年泸州市院士专家工作站第五批建站企业资金资助项目

2022

畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.729
ISSN:0366-6964
年,卷(期):2022.53(2)
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