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北京黑猪HoxB簇基因多态性与脊椎数及胴体性状的关联分析

Association Analysis of Polymorphisms of HoxB Cluster Genes with Vertebral Number and Carcass Traits in Beijing Black Pigs

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旨在对北京黑猪HoxB簇9个基因(HoxB1-7、9和13)的多态性与脊椎数和胴体性状(胴体长、胴体直长、胴体斜长及胴体重)进行关联分析.本研究提取251头220日龄的健康北京黑猪耳组织DNA,对HoxB簇的9个基因通过引物设计、聚合酶链式反应(PCR)技术、Sanger测序技术等对SNPs进行基因分型,并计算变异位点基因型频率以及等位基因频率分布,并与脊椎数和胴体性状进行关联分析.结果,本试验共筛选到4个基因共12个非编码区的(UTR)SNPs,包括HoxB2基因的1个5'UTR突变、HoxB5基因的2个3'UTR突变、HoxB9基因的2个3'UTR突变以及HoxB13基因的7个3'UTR突变.将12个SNPs分别与脊椎数和胴体性状使用Duncan's多重检验统计分析发现,HoxB2基因的1个5'UTR突变(c.40 C＞T)、HoxB5基因的2个3'UTR突变(c.1766 A＞G、c.1767 A＞G)均与性状关联不显著(P＞0.05);而HoxB9基因中的1个3'UTR突变(c.2743 C＞T)与胴体性状关联显著(P＜0.05),HoxB13基因中的2个3'UTR突变(c.1863 G＞A、c.1440 A＞C)与脊椎数关联显著(P＜0.05).综上所述,9个HoxB簇基因中仅HoxB9基因中1个3'UTR突变c.2743 C＞T与胴体性状关联显著(P＜0.05),HoxB13基因2个3'UTR突变c.1863 G＞A、c.1440 A＞C均与脊椎数性状关联显著(P＜0.05),这3个位点可作为北京黑猪脊椎数及胴体性状变异的候选基因功能位点.

牛乃琪、苏艳芳、杨曼、侯欣华、王立刚、张龙超

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中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193

北京黑猪 HoxB9 HoxB13 脊椎数 胴体性状

国家重点研发计划国家生猪产业技术体系建设项目中国农业科学院科技创新工程项目

2021YFD1301101CARS-35CAAS-ZDRW202006-04

2023

10.11843/j.issn.0366-6964.2023.01.011

畜牧兽医学报
中国畜牧兽医学会

畜牧兽医学报

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.729
ISSN：0366-6964
年,卷(期)：2023.54(1)
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