西南大学学报(自然科学版)2023,Vol.45Issue(6) :85-96.DOI:10.13718/j.cnki.xdzk.2023.06.009

利用BSA-Seq筛选甘蓝型油菜菌核病抗性候选基因

Identification of Major Sclerotinia Resistance Genes by BSA-Seq of Brassica napus

夏吉春 彭于洲 王东 李桐舟 张凯 徐新福
西南大学学报(自然科学版)2023,Vol.45Issue(6) :85-96.DOI:10.13718/j.cnki.xdzk.2023.06.009

利用BSA-Seq筛选甘蓝型油菜菌核病抗性候选基因

Identification of Major Sclerotinia Resistance Genes by BSA-Seq of Brassica napus

夏吉春 1彭于洲 1王东 1李桐舟 1张凯 1徐新福1
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作者信息

  • 1. 西南大学 农学与生物科技学院, 重庆 400715
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摘要

油菜菌核病居油菜 3 大病害之首,它所引起的茎腐烂是导致油菜减产的重要原因之一,因此筛选出调控菌核病的主效基因,对利用分子辅助育种手段提高油菜产量具有重要意义.该研究以甘蓝型油菜高抗材料 21Y490 为父本与高感材料 21Y689 杂交,在 F2 分离群体终花期截取油菜茎秆进行核盘菌室内接种,培养 3 d 后测量菌斑大小鉴定菌核病抗性.筛选抗性极端表型个体构建 DNA 混池,与亲本一起重测序提取差异 SNP,InDel 信息,利用BSA-seq技术、ED算法和Δ-index算法获得两个显著的关联区域,分别位于 C09 号染色体的 17.8~21.2 Mb 和31.6~39.1 Mb区间,区间内共有 399 个基因.最后,利用拟南芥和甘蓝型油菜基因组注释信息对关联候选区间对应的基因功能进行分析,共筛选出与油菜菌核病抗性相关的 8 个候选基因(BnaC05g50540D,BnaC09g33900D,BnaA04g09130D,BnaA01g29170D,BnaC09g15640D,BnaC09g35310D,BnaA03g09220D,BnaCnng15460D),通过候选基因同源分析、代谢通路分析及共表达基因分析发现,这些基因主要参与植物激素生长调控及免疫系统的信号转导,为下一步抗性基因的克隆及功能研究奠定了基础.

关键词

甘蓝型油菜/核盘菌/极端性状混池重测序/功能注释

引用本文复制引用

基金项目

国家现代农业产业技术体系资助项目(CARS-12)

出版年

2023
西南大学学报(自然科学版)
西南大学学报编辑部

西南大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.825
ISSN:1673-9868
参考文献量10
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