西南大学学报(自然科学版)2023,Vol.45Issue(7) :87-96.DOI:10.13718/j.cnki.xdzk.2023.07.008

金银花WRKY基因家族的鉴定与功能分析

Identification and Functional Analysis of WRKY Gene Family of Lonicera japonica Thunb.

杨教童 李鹏飞 肖巧巧
西南大学学报(自然科学版)2023,Vol.45Issue(7) :87-96.DOI:10.13718/j.cnki.xdzk.2023.07.008

金银花WRKY基因家族的鉴定与功能分析

Identification and Functional Analysis of WRKY Gene Family of Lonicera japonica Thunb.

杨教童 1李鹏飞 1肖巧巧1
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作者信息

  • 1. 贵州中医药大学 中药民族药资源研究院, 贵阳 550025
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摘要

WRKY转录因子参与调控植物的生长发育、激素应答及逆境应答等过程.基于金银花的基因组数据信息鉴定了WRKY基因家族成员,并分析了WRKY转录因子序列的保守结构域、启动子特点、进化特征、基因重复情况以及在两组不同转录组中的表达情况.结果表明:金银花共有46个WRKY基因,从进化特点上可分为3个亚家族,基因数量分别为16,13,17个.WRKY家族成员的蛋白分子量在15963.55~80967.23 Da之间,氨基酸数量在149~748之间,等电点在4.75~9.71之间,不稳定系数在40.97~67.76之间.参与生长发育、激素应答的元件出现在金银花WRKY基因的启动子区域.通过分析两组不同的表达谱数据发现,WRKY转录因子可能参与了调控金银花的开花过程.研究为进一步开展金银花WRKY家族基因的功能研究奠定了基础.

关键词

金银花/WRKY基因/功能分析

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基金项目

国家自然科学基金(32260140)

国家自然科学基金(32160139)

贵州中医药大学博士启动基金([2019]141)

贵州中医药大学博士启动基金([2020]32)

出版年

2023
西南大学学报(自然科学版)
西南大学学报编辑部

西南大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子:0.825
ISSN:1673-9868
参考文献量4
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