西南大学学报(自然科学版)2023，Vol.45Issue(11) ：70-80.DOI:10.13718/j.cnki.xdzk.2023.11.008

基于转录组测序挖掘马铃薯块茎采后发芽关键基因

Identification of Critical Genes Involved in Postharvest Sprouting of Potato Tubers Based on RNA-seq Analysis

吴林 杨苏渝 杨阳 廖喜梅 朱学栋 朱菲菲 梁峰铭 李勇 吕典秋
西南大学学报(自然科学版)2023，Vol.45Issue(11) ：70-80.DOI:10.13718/j.cnki.xdzk.2023.11.008
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基于转录组测序挖掘马铃薯块茎采后发芽关键基因

Identification of Critical Genes Involved in Postharvest Sprouting of Potato Tubers Based on RNA-seq Analysis

吴林 1杨苏渝 2杨阳 2廖喜梅 2朱学栋 3朱菲菲 3梁峰铭 4李勇 5吕典秋1
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作者信息

  • 1. 西南大学 西部(重庆)科学城种质创制大科学中心,重庆 400715;西南大学 农学与生物科技学院,重庆 400715;薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室,重庆 400715
  • 2. 西南大学 农学与生物科技学院,重庆 400715
  • 3. 重庆市渝东南农业科学院,重庆 涪陵 408099
  • 4. 巫溪县署光农业科技发展有限公司,重庆 巫溪 405899
  • 5. 安顺学院 农学院,贵州 安顺 561000
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摘要

马铃薯是全球第 4 大粮食作物,营养丰富.然而,马铃薯块茎采后发芽显著影响其商品价值和种薯质量.该研究结合表型观察、细胞学分析、生理生化检测、植物激素含量测定、Marker基因表达分析等,明确了马铃薯采后发芽的关键时期.通过对马铃薯块茎采后发芽关键时期样本进行 RNA-seq分析,挖掘了马铃薯块茎采后发芽关键基因.结果表明'费乌瑞它'马铃薯块茎采后休眠解除期为 30 d,芽生长期为 45 d.从休眠期到休眠解除期和休眠解除期到芽生长期分别有 1 008 个基因(252 个上调、756 个下调)和 4 576 个基因(2 800 个上调、1 696 个下调)表达量发生显著变化.156 个转录因子基因(主要属于 AP2、MYB 和 bHLH 家族)及植物激素(ABA 与GA)合成、代谢、信号转导相关基因,如NCED4,ZEP,KS,KO2,ABI5 等.这些差异表达基因主要富集在苯丙烷生物合成(ko00940)、苯丙氨酸代谢(ko00360)、类胡萝卜素生物合成(ko00100)、DNA 复制(ko03030)、糖代谢(ko00520)等通路.

关键词

马铃薯块茎/采后发芽/转录组/关键基因

Key words

potato tuber/postharvest sprouting/transcriptome/critical genes

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基金项目

国家重点研发计划(2018YFE0127900)

国家重点研发计划(2022YFD1201600)

中央高校基本科研业务费专项(SWU-KR22042)

重庆市科技局技术创新与应用发展专项重点项目(CSTB2022TIAD-CUX0012)

贵州省普通高等学校青年科技人才成长项目(黔教合KY字[2019]146)

出版年

2023
西南大学学报(自然科学版)
西南大学学报编辑部

西南大学学报(自然科学版)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.825
ISSN：1673-9868
被引量1
参考文献量6
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