摘要
利用玉米基因组等多种数据库搜索CaM家族基因,对玉米CaM基因家族进行筛选与鉴定,对家族成员的基因结构、等电点、分子量、亚细胞定位、蛋白保守域等蛋白基本特性进行分析.同时分析不同组织和干旱胁迫条件下该类基因的表达情况,进一步利用qRT-PCR技术检测5个具有代表性的CaM基因在干旱处理条件下的表达变化.结果显示,共获得14个CaM基因,根据3'-UTR序列构建的系统进化树显示可分为4个亚家族.根据蛋白质的氨基酸序列,可分为3种亚型.家族成员蛋白分子量大多数为16.8kD左右,等电点介于4.10～4.30,该家族蛋白保守结构域由3～4个EF手型结构域组成,主要定位于细胞质和细胞核.Zmcal4、Zmcal5和Zmcal6基因在各组织中表达非常低,干旱会抑制家族大部分成员的表达,覆水处理后,Zmcal3-1、Zmcal3-2、Zmcal3-3、Zmcal3-4的表达可恢复到对照水平,推测这几个基因可能参与干旱胁迫反应.qRT-PCR结果表明,干旱会抑制CaM基因的表达,随着干旱处理时间的增加,CaM基因的表达量逐渐降低,与生信分析结果一致.
基金项目
河北省高等学校科学技术研究项目(QN2017082)
西北农林科技大学旱区作物逆境生物学国家重点实验室开放课题(CSBAA2019006)
华北作物改良与调控国家重点实验室自主研究课题(1220501)
NETL
NSTL
维普
万方数据