摘要
为解析杜鹃花科质体基因结构特征,并澄清杜鹃花科内部的系统发育关系,利用Genbank数据库已公开发表的杜鹃花科 13 属 51 个物种的质体基因组数据,对其基因组大小、重复序列等进行统计分析,并采用最大似然法和贝叶斯推断重建其系统发育树.结果显示:(1)异养类群的质体基因组大小为 26～40 kb,自养类群的为150～230 kb,二者差异显著;非杜鹃属物种的基因组大小为 150～195 kb,杜鹃属物种的为 152～230 kp,二者差异显著.(2)简单重复序列(SSRs)、串联重复序列和散在重复序列在异养和自养类群间、非杜鹃属和杜鹃属物种间差异均显著.(3)杜鹃花科的系统发育关系分析表明,支持率≥95%的分支占总分支数目的 87%,杜鹃花科为单系类群,草莓树亚科和水晶兰亚科为姐妹群,二者与鹿蹄草亚科形成的分支为较早分化的类群,越橘亚科和Ericoideae为姐妹群.草莓树亚科除外(仅包括一个种),其余 4 个亚科均为单系.属级水平,杜鹃属和白珠属为单系,越橘属和水晶兰属不为单系.杜鹃属内部,羊踯躅亚属和常绿杜鹃亚属为姐妹群,二者与杜鹃亚属形成中等支持率的一支,马银花亚属和映山红亚属为姐妹群.(4)杜鹃属 19 个物种中序列长度≥200 bp的共有单拷贝基因数目为 36 个,基因的变异率范围为 0.81%～11.73%;越橘属 12 个物种的共有单拷贝基因数目为 32 个,变异率范围为 0～9.09%.
基金项目
国家自然科学基金(3220151928)
河南省科技攻关计划(222102110015)
周口师范学院科技支撑计划(ZKNUC2021050)
维普
万方数据