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拟南芥、水稻SUTs基因及其上游序列的系统发生关系

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[目的]对拟南芥(Arabidopsis thaliana)、水稻(Oryza sativa) SUTs家族的基因及其上游区的序列进行了核酸组成和系统发生关系的分析,为深入研究该基因作用及其分子调控机制提供参考.[方法]利用邻近法和基因结构分析,解析SUTs基因及其上游序列的系统发生关系.[结果]水稻SUTs基因及其上游区的GC含量都明显高于拟南芥;拟南芥和水稻SUTs基因的序列长度与GC含量呈明显负相关,其基因结构分类与邻近法分类相一致,都可分为3个亚族;拟南芥SUCs上游区的序列长度与其GC含量的相关性不明显,而水稻的SUTs上游区序列长度与其GC含量有较弱的负相关性.此外,拟南芥4个SUC基因(AtSUC6～9)上游序列的系统发生关系与基因序列的系统发生完全一致,但其他的AtSUCs和OsSUTs基因的上游序列系统发生关系与基因序列的系统发生关系并不一致.[结论]SUTs基因在进化过程中其序列和基因结构相对保守,而其上游序列在进化过程变化较大,揭示了SUTs基因调控序列的复杂性.
Phylogenetic Relationship of SUTs Genes and Their Upstream Sequences in Arabidopsis thaliana and Oryza sativa

李丹丹、李娟、张春龙、徐汝聪、吕东、谭亚玲、谭学林

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云南农业大学农学与生物技术学院,云南昆明650201

云南农业大学稻作研究所,云南昆明650201

SUTs基因 上游序列 基因结构 系统发生 模式植物

国家重点研发计划

2016YFD0101101

2018

云南农业大学学报(自然科学)
云南农业大学

云南农业大学学报(自然科学)

CSCD北大核心
影响因子：0.828
ISSN：1004-390X
年,卷(期)：2018.33(3)
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