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药用石斛及其混伪品的DNA条形码分子鉴定

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[目的]筛选合适的DNA条形码序列并建立高效准确鉴定药用石斛(Dendrobium)的方法.[方法]以12种药用石斛的82个样品为材料,提取样品总DNA,对核基因片段ITS和ITS2、叶绿体基因片段psbA-tmH和matK序列进行扩增和测序;利用生物信息学软件进行序列特征、DNA条形码序列间隔(barcoding gap)和系统发育分析.[结果]4条序列扩增成功率均为100％,其中ITS和ITS2测序成功率最高,均为97.6％,其次是matK为96.3％,psbA-tmH为95.1％;ITS和ITS2序列与其他序列相比,种内和种间存在重叠的部分较少,具有条形码序列间隔.系统发育树表明:ITS和ITS2序列能够成功区分12种药用石斛及混伪品,psbA-trnH序列未能把叠鞘石斛(D.aurantiacum Rchb.f.var.denneanum)、双斑叠鞘石斛(D.aurantiacum Rchb.f.var.zhaojuense)和流苏石斛(D.fimbriatum)以及混伪品全部区分开,matK序列未能把叠鞘石斛和流苏石斛区分开;4条序列联合构建的系统发育树与ITS和ITS2单序列构建的系统发育树相似.[结论]以ITS和ITS2序列为主,psbA-trnH和matK序列为辅的DNA条形码鉴定方法能够对药用石斛及其混伪品进行快速准确的鉴定.
Molecular Identification of Medicinal Dendrobium and Its Adulterants Based on DNA Barcoding

徐素素、高静、陈军文、赫京生、刘祥宇、张敬丽

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云南农业大学园林园艺学院,云南昆明650201

云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心,云南昆明650201

云南农业大学云南省药用植物生物学重点试验室,云南昆明650201

云南农业大学农学与生物技术学院,云南昆明650201

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药用石斛 DNA条形码 系统发育分析 分子鉴定

云南省重大科技专项国家重点研发计划云南省教育厅科学研究基金

2017ZF0032017YFC17022052021Y184

2021

10.12101/j.issn.1004-390X(n).202010051

云南农业大学学报(自然科学)
云南农业大学

云南农业大学学报(自然科学)

CSTPCDCSCD北大核心
影响因子：0.828
ISSN：1004-390X
年,卷(期)：2021.36(5)
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