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涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(PAL)的生物信息学及表达分析

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[目的]解析涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase，PAL)的差异，研究不同发育时期、不同环境和外源因子处理下PAL基因表达规律。[方法]基于基因克隆和生物信息学方法研究PAL基因和蛋白特性;利用荧光定量PCR及酶活性测定方法测定PAL表达量及酶活性。[结果]克隆得到涮辣PAL基因为2166 bp，昆明皱皮椒PAL基因为2154 bp，分别编码721和717个氨基酸。顺式元件预测结果显示:辣椒PAL可能受赤霉素、光与干旱的影响。PAL蛋白预测结果表明:PAL为脂溶性、亲水性的稳定蛋白，主要定位于质膜，无信号肽与跨膜结构，含58个磷酸化位点。在进化上PAL有保守性，但在亚组上存在一定差异。在不同发育阶段，2种辣椒PAL表达水平与酶活性的趋势都为先升高后急剧降低，且在大部分发育阶段均表现为露地栽培高于大棚栽培;同一环境条件下，涮辣PAL表达与酶活性整体高于昆明皱皮椒;且不同外源物质在一定时间内可影响涮辣PAL的表达。[结论]涮辣与昆明皱皮椒PAL基因和蛋白特性相似但存在差异，在辣椒生长发育、环境和外源物质响应方面有重要功能。
Bioinformatics and Expression Analysis of Phenylalanine Ammo-nia-lyase (PAL) from ShuanLa (Capsicum chinense) and Kunming Wrinkled Pepper (C. annuum)

张祥、刘雨婷、张婧柔、李平平、谢志和、张芮豪、邓明华

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云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明 650201

云南省通海县经济作物工作站,玉溪市邓明华专家基层科研工作站,云南 通海 652700

涮辣 昆明皱皮椒 苯丙氨酸解氨酶 (PAL) 生物信息学 外源因子

云南省科技厅重大专项玉溪市专家基层科研工作站项目

2018BB020

2022

云南农业大学学报(自然科学)
云南农业大学

云南农业大学学报(自然科学)

北大核心
影响因子：0.828
ISSN：1004-390X
年,卷(期)：2022.37(2)
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