云南农业大学学报(自然科学)2022，Vol.37Issue(2) ：320-329.

涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(PAL)的生物信息学及表达分析

Bioinformatics and Expression Analysis of Phenylalanine Ammo-nia-lyase (PAL) from ShuanLa (Capsicum chinense) and Kunming Wrinkled Pepper (C. annuum)

张祥 刘雨婷 张婧柔 李平平 谢志和 张芮豪 邓明华
云南农业大学学报(自然科学)2022，Vol.37Issue(2) ：320-329.
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涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(PAL)的生物信息学及表达分析

Bioinformatics and Expression Analysis of Phenylalanine Ammo-nia-lyase (PAL) from ShuanLa (Capsicum chinense) and Kunming Wrinkled Pepper (C. annuum)

张祥 1刘雨婷 1张婧柔 1李平平 1谢志和 1张芮豪 1邓明华2
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作者信息

  • 1. 云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明 650201
  • 2. 云南农业大学 园林园艺学院,云南 昆明 650201;云南省通海县经济作物工作站,玉溪市邓明华专家基层科研工作站,云南 通海 652700
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摘要

[目的]解析涮辣与昆明皱皮椒苯丙氨酸解氨酶(phenylalanine ammonia-lyase,PAL)的差异,研究不同发育时期、不同环境和外源因子处理下PAL基因表达规律.[方法]基于基因克隆和生物信息学方法研究PAL基因和蛋白特性;利用荧光定量PCR及酶活性测定方法测定PAL表达量及酶活性.[结果]克隆得到涮辣PAL基因为2166 bp,昆明皱皮椒PAL基因为2154 bp,分别编码721和717个氨基酸.顺式元件预测结果显示:辣椒PAL可能受赤霉素、光与干旱的影响.PAL蛋白预测结果表明:PAL为脂溶性、亲水性的稳定蛋白,主要定位于质膜,无信号肽与跨膜结构,含58个磷酸化位点.在进化上PAL有保守性,但在亚组上存在一定差异.在不同发育阶段,2种辣椒PAL表达水平与酶活性的趋势都为先升高后急剧降低,且在大部分发育阶段均表现为露地栽培高于大棚栽培;同一环境条件下,涮辣PAL表达与酶活性整体高于昆明皱皮椒;且不同外源物质在一定时间内可影响涮辣PAL的表达.[结论]涮辣与昆明皱皮椒PAL基因和蛋白特性相似但存在差异,在辣椒生长发育、环境和外源物质响应方面有重要功能.

关键词

涮辣/昆明皱皮椒/苯丙氨酸解氨酶 (PAL)/生物信息学/外源因子

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基金项目

云南省科技厅重大专项(2018BB020)

玉溪市专家基层科研工作站项目()

出版年

2022
云南农业大学学报(自然科学)
云南农业大学

云南农业大学学报(自然科学)

北大核心
影响因子：0.828
ISSN：1004-390X
被引量2
参考文献量15
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