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四川省猪流行性腹泻病毒SNJ-P株的分离鉴定与遗传进化分析

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[目的]探究四川省猪流行性腹泻病毒(PEDV)毒株流行变异情况,并分析疫苗免疫效果不佳的原因。[方法]从四川某猪场采集仔猪肠道样本进行PCR检测、病毒纯化、病毒滴度测定以及病毒感染等试验;测定分离株全基因组序列,将分离株S基因序列与其他地区毒株及疫苗株进行比对并构建进化树;比较分离株与经典疫苗株CV777 S蛋白氨基酸位点变异情况。[结果]成功分离获得1株PEDV毒株,并命名为PEDV SNJ-P,该毒株病毒滴度为1×107。5/100μL。动物感染试验表明:分离株能引起仔猪出现腹泻和脱水等症状并导致死亡。全基因组测序及遗传进化分析表明:PEDV SNJ-P株全基因共28003 bp,基因型为S non-INDEL型;与同型的中国分离株PEDV-WS、CH/JLDH/2016和CH/HNLH/2015等毒株亲缘关系较近,与同型的疫苗株亲缘关系相对较远,与经典疫苗株亲缘关系较远。与经典疫苗株CV777相比,SNJ-P株的S蛋白存在多处氨基酸突变、缺失和插入现象。[结论]由于毒株出现变异,SNJ-P株与疫苗株亲缘关系较远,当前所用疫苗无法提供有效保护。本研究结果以期为国内PEDV毒株的研究及疫苗开发提供借鉴。

庞茂楠、蒋子睿、王印、罗燕、姚学萍、杨泽晓

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四川农业大学 动物医学院,四川 成都 611130

动物疫病与人类健康四川省重点实验室,四川 成都 611130

猪流行性腹泻病毒 分离鉴定 S蛋白基因 遗传进化分析

2021YFSY0005

2022

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北大核心
影响因子:0.828
ISSN:1004-390X
年,卷(期):2022.37(5)
庞茂楠,蒋子睿,王印,等.四川省猪流行性腹泻病毒SNJ-P株的分离鉴定与遗传进化分析[J].云南农业大学学报(自然科学),2022,37(5):790-798.
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