摘要
[目的]从桃基因组鉴定Q型C2H2锌指蛋白基因家族成员,并进行生物信息学与低温表达分析,为桃抗逆性研究提供理论依据.[方法]采用生物信息学方法分析桃46个Q型C2H2锌指蛋白家族成员的理化性质、系统进化和基因结构等,并利用实时荧光定量分析其低温胁迫下的表达特征.[结果]桃Q型C2H2锌指蛋白家族成员氨基酸数量介于155～607,且主要位于细胞核中.染色体定位揭示该家族成员不均匀地分布在8条染色体上.系统进化分析将桃和拟南芥的Q型C2H2基因聚为16个亚组.基因结构分析表明:同一亚族成员结构相似,外显子数量基本相同.顺式作用元件分析表明:大多数Q型C2H2锌指蛋白家族成员启动子序列上游2000 bp区域包含大量激素及非生物胁迫响应元件.qRT-PCR分析表明:低温胁迫下,桃Q型C2H2锌指蛋白家族成员中有16个成员为上调表达,且以PpC2H2-18基因最为显著.[结论]该家族成员均含有较高的保守基序和结构域,且可参与植物生长发育以及生物和非生物胁迫等,为桃的抗寒育种提供了参考.
国家科技期刊平台
NSTL
维普
万方数据