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桃Q型C2H2锌指蛋白基因家族的鉴定及其在低温胁迫下的表达分析

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[目的]从桃基因组鉴定Q型C2H2锌指蛋白基因家族成员,并进行生物信息学与低温表达分析,为桃抗逆性研究提供理论依据。[方法]采用生物信息学方法分析桃46个Q型C2H2锌指蛋白家族成员的理化性质、系统进化和基因结构等,并利用实时荧光定量分析其低温胁迫下的表达特征。[结果]桃Q型C2H2锌指蛋白家族成员氨基酸数量介于155~607,且主要位于细胞核中。染色体定位揭示该家族成员不均匀地分布在8条染色体上。系统进化分析将桃和拟南芥的Q型C2H2基因聚为16个亚组。基因结构分析表明:同一亚族成员结构相似,外显子数量基本相同。顺式作用元件分析表明:大多数Q型C2H2锌指蛋白家族成员启动子序列上游2000 bp区域包含大量激素及非生物胁迫响应元件。qRT-PCR分析表明:低温胁迫下,桃Q型C2H2锌指蛋白家族成员中有16个成员为上调表达,且以PpC2H2-18基因最为显著。[结论]该家族成员均含有较高的保守基序和结构域,且可参与植物生长发育以及生物和非生物胁迫等,为桃的抗寒育种提供了参考。
Identification of Q-type C2H2 Zinc Finger Protein Gene Family and Their Expression Analysis under Low Temperature Stress in Prunus persica

郝兰兰、马乃膺、张仲兴、李小兰、王鸿

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甘肃农业大学 园艺学院,甘肃 兰州 730070

甘肃省农业科学院 林果花卉研究所,甘肃 兰州 730070

Q型C2H2锌指蛋白 低温胁迫 表达分析

31760558CARS30-1-6

2022

云南农业大学学报(自然科学)
云南农业大学

云南农业大学学报(自然科学)

北大核心
影响因子:0.828
ISSN:1004-390X
年,卷(期):2022.37(5)
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