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不同类型植物病原物中分泌蛋白及CAZymes对比研究

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[目的]通过对不同类型植物病原物中分泌蛋白及碳水化合物活性酶(CAZymes)进行系统对比分析，为深入解析分泌蛋白及CAZymes在不同植物病原物致病机制中的重要作用提供理论基础。[方法]选择9种真菌、5种细菌和9种卵菌共23种不同类型病原物作为研究对象，根据分泌蛋白的基本特征，采用SignalP v5。0等在线分析程序对病原物中的分泌蛋白进行预测;利用在线工具dbCAN对获取的分泌蛋白进行CAZymes预测;最终对3种类型植物病原物预测结果进行系统对比分析。[结果]真菌、细菌和卵菌的分泌蛋白数量分别为71～510、105-227和119～768个，所占比例分别为0。74％～3。93％、2。05％～3。91％和0。96％～2。90％;真菌、细菌和卵菌中含有的CAZymes平均数量分别为26、4和26个，种类分别为62～76、8～14和24～36种，其中真菌中AA9、GH11和GH28等类别的CAZymes数量较多，细菌中GH25和PL_6的数量较多，卵菌中PL3 2和GH17的数量较多。[结论]卵菌的分泌蛋白占比较小，真菌的分泌蛋白占比最值差异较大;细菌的CAZymes数量与种类最少，真菌的CAZymes种类最多，显示了不同类型植物病原物与植物互作以及种间竞争等协同进化过程中存在共性化和差异化的毒性策略。
Comparative Study of Secretory Proteins and CAZymes in Different Types of Plant Pathogens

夏雄飞、陈云芳、覃悦、韩长志

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西南林业大学生物多样性保护学院,云南昆明650224

中华人民共和国苏州海关,江苏苏州215000

云南省森林灾害预警与控制重点实验室,云南昆明650224

植物病原物 分泌蛋白 CAZymes 生物信息学

国家自然科学基金云南省高层次人才培养支持计划"青年拔尖人才"专项云南省应用基础研究计划项目

31960314YN-WR-QNBJ-2020-1882018FG001-028

2022

云南农业大学学报(自然科学)
云南农业大学

云南农业大学学报(自然科学)

北大核心
影响因子：0.828
ISSN：1004-390X
年,卷(期)：2022.37(6)
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