首页|百合AP2/ERF家族转录因子基因LoERF4的克隆和生物信息学分析

百合AP2/ERF家族转录因子基因LoERF4的克隆和生物信息学分析

扫码查看
原文链接
  • 万方数据
  • 维普
[目的]研究AP2/ERF家族成员ERF基因在百合休眠解除过程中的作用。[方法]以百合品种西伯利亚(Lilium oriental'Siberia')的小鳞茎为试验材料，从前期试验获得的转录组测序数据中筛选得到1个在小鳞茎休眠解除过程中显著上调表达的ERF转录因子，结合RT-PCR技术扩增得到西伯利亚小鳞茎的ERF基因cDNA全长序列，命名为LoERF4;通过多种生物信息学软件对LoERF4的基因结构和理化性质等进行分析;利用荧光定量qRT-PCR技术检测LoERF4基因在小鳞茎休眠解除过程中的相对表达量。[结果]通过克隆得到LoERF4基因全长，该基因开放阅读框全长为606 bp，编码201个氨基酸，含有1个典型的保守AP2结构域;蛋白相对分子量约为21。52 ku，理论等电点为6。43，为亲水性蛋白，没有跨膜结构。qRT-PCR分析结果显示:在西伯利亚小鳞茎休眠解除过程中，该基因的表达量在第20天小鳞茎休眠解除、开始萌发时极显著升高。[结论]在百合中克隆得到的LoERF基因可能是参与调控百合小鳞茎休眠解除进程的关键因子之一。
Cloning and Bioinformatics Analysis of AP2/ERF Transcription Factor Gene LoERF4 in Lily

王浩、孙亮、张济民、贾文杰、吴雅文、张小平、李想、王有国

展开 >

云南农业大学园林园艺学院,云南昆明650201

金华职业技术学院农学院,浙江金华321017

云南省农业科学院花卉研究所,云南昆明650205

百合(Lilium spp.) LoERF4 基因克隆 生物信息学分析

国家自然科学基金国家重点研发计划项目

320606902018YFD1000402

2022

云南农业大学学报(自然科学)
云南农业大学

云南农业大学学报(自然科学)

北大核心
影响因子：0.828
ISSN：1004-390X
年,卷(期)：2022.37(6)
  • 1
  • 28