摘要
[目的]鉴定大白菜COBRA基因家族成员,分析基因在低温胁迫下的表达并预测基因功能.[方法]利用生物信息学方法对大白菜的COBRA基因家族进行鉴定,并对基因结构、系统进化、启动子元件和表达模式进行分析.[结果]大白菜COBRA基因家族包含23个成员,命名为BrCOBL1～BrCOBL23,分布于大白菜基因组的8条染色体上,根据基因序列特点将其分为2个亚族.大白菜与同属于十字花科的拟南芥、甘蓝型油菜、甘蓝和芥菜基因组中共鉴定出147个COBRA基因,系统进化树分析表明以上COBRA基因家族成员可聚为8个亚组.基因表达分析显示:低温胁迫下,大白菜BrCOBL1、BrCOBL2、BrCOBL15 和 BrCOBL16 的表达量显著升高.[结论]COBRA蛋白序列含有共同的保守基序,且某些基序特异存在于不同的亚族,表明这些基序可能与各亚族的功能分化有关.根据启动子分析结果推测BrCOBL基因可能参与大白菜的非生物胁迫响应及激素应答调控.
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