大白菜COBRA基因家族鉴定及其低温胁迫表达分析

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中文摘要：[目的]鉴定大白菜COBRA基因家族成员，分析基因在低温胁迫下的表达并预测基因功能。[方法]利用生物信息学方法对大白菜的COBRA基因家族进行鉴定，并对基因结构、系统进化、启动子元件和表达模式进行分析。[结果]大白菜COBRA基因家族包含23个成员，命名为BrCOBL1～BrCOBL23，分布于大白菜基因组的8条染色体上，根据基因序列特点将其分为2个亚族。大白菜与同属于十字花科的拟南芥、甘蓝型油菜、甘蓝和芥菜基因组中共鉴定出147个COBRA基因，系统进化树分析表明以上COBRA基因家族成员可聚为8个亚组。基因表达分析显示:低温胁迫下，大白菜BrCOBL1、BrCOBL2、BrCOBL15 和 BrCOBL16 的表达量显著升高。[结论]COBRA蛋白序列含有共同的保守基序，且某些基序特异存在于不同的亚族，表明这些基序可能与各亚族的功能分化有关。根据启动子分析结果推测BrCOBL基因可能参与大白菜的非生物胁迫响应及激素应答调控。

外文标题：Identification and Expression Analysis under Low Temperature Stress of COBRA Gene Family in Brassica rapa L.

作者：

廉瑞婷、任宏、翟文、陈连水、汤晓辛

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作者单位：

贵州师范大学生命科学学院,贵州贵阳550025

东华理工大学化学生物与材料科学学院,江西南昌330013

关键词：

大白菜 COBRA基因家族基因表达分析低温胁迫

基金：

国家自然科学基金国家自然科学基金国家自然科学基金国家自然科学基金

项目编号：

U1812401315601843130031731760076

出版年：

2022

云南农业大学学报(自然科学)

云南农业大学

云南农业大学学报(自然科学)

北大核心

影响因子：0.828

ISSN：1004-390X

年,卷(期)：2022.37(6)

参考文献量30