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酿酒酵母PAD1基因生物信息学分析

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[目的]研究酿酒酵母中PAD1基因的功能，为研究酿酒酵母芳香族化合物代谢过程和途径奠定基础。[方法]对酿酒酵母PAD1基因进行电子克隆，再采用生物信息学分析法对PAD1基因进行分析预测。[结果]酿酒酵母PAD1基因位于Ⅳ染色体1510902～1511630，全长729bp，可编码242个氨基酸;系统进化树分析表明:该基因编码的蛋白质与肉桂酸脱羧酶(AAA20484。1)最为接近，同源性高达99。59％;蛋白质化学式为C1208H1950N328O336S9，分子量约为26 733。31 ku，是稳定的疏水蛋白，在线粒体中发挥作用。二级结构预测结果未发现明显卷曲螺旋区域，有部分跨膜区存在，二级结构元件以a-螺旋和随机卷曲为主，延伸链和β-转角在蛋白质中分散存在。[结论]酿酒酵母PAD1基因是编码芳香族羧酸脱羧酶的基因，编码的蛋白质结构稳定，可能在线粒体中参与代谢，与酿酒酵母芳香族羧酸的代谢和其对芳香族羧酸的耐受性存在直接联系。
Bioinformatics Analysis of PAD1 Gene of Saccharomyces cerevisiae

尹拓、马福仙、韩沛辰、奚登贤、张汉尧

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西南林业大学林学院,西南地区生物多样性保育国家林业与草原局重点实验室,云南昆明650224

酿酒酵母PAD1基因 基因电子克隆 生物信息学分析 芳香族羧酸脱羧酶

国家自然科学基金云南省农业基础研究联合专项基金

317604502018FG001-038

2022

云南农业大学学报(自然科学)
云南农业大学

云南农业大学学报(自然科学)

北大核心
影响因子：0.828
ISSN：1004-390X
年,卷(期)：2022.37(6)
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